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小雨莎莎木蟲 (正式寫手)
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[交流]
請教如何預(yù)測一段氨基酸序列的親水性？ 已有1人參與
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| 篩選出一系列的多肽序列，想要預(yù)測一下它們的親水性如何，不知道該怎么計(jì)算或者有什么網(wǎng)站可以直接輸入序列就能給出結(jié)果的？謝謝各位！ |
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
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1.使用ProtParam（physico-chemical parameters of a protein sequences，http://web.expasy.org/protparam/）在線軟件計(jì)算氨基酸理化參數(shù)。操作時(shí)可直接輸入已知蛋白的Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫記錄號或標(biāo)識符，或?qū)⒉话ㄗ⑨屝械奈粗鞍踪|(zhì)序列輸入對應(yīng)文本框中。點(diǎn)擊Compute Parameters獲取結(jié)果，結(jié)果包括蛋白質(zhì)分子量、理論等電點(diǎn)、氨基酸組成、帶電荷氨基酸數(shù)目統(tǒng)計(jì)、原子組成、消光系數(shù)、半衰期、不穩(wěn)定系數(shù)、總平均疏水性等信息。 2.使用ExPASy的ProtScale程序（http://www.expasy.org/cgi-bin/protscale.pl）分析蛋白質(zhì)的親疏水性，得到親疏水性圖譜。 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
小雨莎莎2樓2012-10-16 07:15:25
小雨莎莎
木蟲 (正式寫手)
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3樓2012-10-16 10:13:31
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