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小雨莎莎木蟲 (正式寫手)
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[交流]
請教如何預測一段氨基酸序列的親水性？ 已有1人參與
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| 篩選出一系列的多肽序列，想要預測一下它們的親水性如何，不知道該怎么計算或者有什么網站可以直接輸入序列就能給出結果的？謝謝各位！ |
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
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1.使用ProtParam（physico-chemical parameters of a protein sequences，http://web.expasy.org/protparam/）在線軟件計算氨基酸理化參數(shù)。操作時可直接輸入已知蛋白的Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫記錄號或標識符，或將不包括注釋行的未知蛋白質序列輸入對應文本框中。點擊Compute Parameters獲取結果，結果包括蛋白質分子量、理論等電點、氨基酸組成、帶電荷氨基酸數(shù)目統(tǒng)計、原子組成、消光系數(shù)、半衰期、不穩(wěn)定系數(shù)、總平均疏水性等信息。 2.使用ExPASy的ProtScale程序（http://www.expasy.org/cgi-bin/protscale.pl）分析蛋白質的親疏水性，得到親疏水性圖譜。 |
小雨莎莎2樓2012-10-16 07:15:25
小雨莎莎
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3樓2012-10-16 10:13:31
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