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apollosun9283金蟲(chóng) (小有名氣)
劍橋公爵
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CASTEP和DMo3l做離子型晶體幾何優(yōu)化的問(wèn)題
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一般說(shuō)來(lái),做晶體的表面吸附,首先需要對(duì)晶體進(jìn)行幾何優(yōu)化,然后切面建slab模型。 為此,最開(kāi)始我們需要查找待研究的晶體所屬的空間群、晶格常數(shù),這樣建出來(lái)的晶體是有空間群性質(zhì)限制的,即α、β、γ是固定的。 現(xiàn)在有一下幾個(gè)問(wèn)題: 其一,晶體建好以后,用CASTEP做幾何優(yōu)化,勾選optimize cell, 是不是優(yōu)化后,a、b、c的數(shù)值會(huì)變,但是角度α、β、γ不會(huì)變呢? 其二,晶體建好以后,Make P1,用CASTEP做幾何優(yōu)化,勾選optimize cell, 是不是優(yōu)化后,不僅a、b、c的數(shù)值會(huì)變,而且角度α、β、γ也會(huì)變呢? 其三,因?yàn)榫w幾何優(yōu)化會(huì)影響到后續(xù)的slab模型,那么用CASTEP做表面吸附時(shí),晶體幾何的幾何優(yōu)化,到底需不需要make P1呢? 其四,有位同學(xué)告訴我,即使make P1后,角度α、β、γ(假設(shè)初始α=β=γ=90°)會(huì)變化,但是正確的幾何優(yōu)化結(jié)果,經(jīng)過(guò)若干次迭代后,還是α=β=γ=90°,這個(gè)說(shuō)法對(duì)嗎? 其五,用DMol3做幾何優(yōu)化,不勾選Use Symmetry做幾何優(yōu)化,是不是效果相當(dāng)于make P1了? 問(wèn)題比較多,請(qǐng)大家?guī)蛶兔!萬(wàn)分感謝! |
計(jì)算MS等 | 第一性學(xué)習(xí) |

鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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其一,晶體建好以后,用CASTEP做幾何優(yōu)化,勾選optimize cell, 是不是優(yōu)化后,a、b、c的數(shù)值會(huì)變,但是角度α、β、γ不會(huì)變呢? 答:用CASTEP對(duì)晶體進(jìn)行幾何優(yōu)化,必須選中optimize cell。 若保持原有對(duì)稱性不變的前提下,優(yōu)化過(guò)程中,a、b、c的數(shù)值會(huì)發(fā)生改變并最終分別收斂到某值,但是在整個(gè)優(yōu)化過(guò)程中角度α、β、γ保持不變。 其二,晶體建好以后,Make P1,用CASTEP做幾何優(yōu)化,勾選optimize cell, 是不是優(yōu)化后,不僅a、b、c的數(shù)值會(huì)變,而且角度α、β、γ也會(huì)變呢? 答:若將晶胞對(duì)稱性設(shè)為P1,則在優(yōu)化過(guò)程中,a、b、c和α、β、γ的數(shù)值都會(huì)發(fā)生改變并最終分別收斂到某值,具體收斂程度及最終數(shù)值與計(jì)算精度和采用的優(yōu)化函數(shù)等有關(guān)。 其三,因?yàn)榫w幾何優(yōu)化會(huì)影響到后續(xù)的slab模型,那么用CASTEP做表面吸附時(shí),晶體幾何的幾何優(yōu)化,到底需不需要make P1呢? 答:make P1的作用是降低晶胞的對(duì)稱性,但是不改變晶胞的周期性。其目的是在優(yōu)化過(guò)程中能夠按能量最低原理找出晶胞中具體原子的最可能存在的由對(duì)稱性決定的位置,所以選擇make P1通常用于晶胞結(jié)構(gòu)變化較大的情況(如摻雜、替換原子等)。 其四,有位同學(xué)告訴我,即使make P1后,角度α、β、γ(假設(shè)初始α=β=γ=90°)會(huì)變化,但是正確的幾何優(yōu)化結(jié)果,經(jīng)過(guò)若干次迭代后,還是α=β=γ=90°,這個(gè)說(shuō)法對(duì)嗎? 答:該說(shuō)法基本是準(zhǔn)確的,但有些提法不嚴(yán)謹(jǐn),“正確的幾何優(yōu)化結(jié)果”這種說(shuō)法就不嚴(yán)謹(jǐn),沒(méi)有絕對(duì)正確,只有相對(duì)正確。 其五,用DMol3做幾何優(yōu)化,不勾選Use Symmetry做幾何優(yōu)化,是不是效果相當(dāng)于make P1了? 答:基本相同。 |
鐵蟲(chóng) (初入文壇)
榮譽(yù)版主 (文壇精英)
魚(yú)大嬸
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