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apollosun9283金蟲(chóng) (小有名氣)
劍橋公爵
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[求助]
CASTEP和DMo3l做離子型晶體幾何優(yōu)化的問(wèn)題
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一般說(shuō)來(lái)，做晶體的表面吸附，首先需要對(duì)晶體進(jìn)行幾何優(yōu)化，然后切面建slab模型。 為此，最開(kāi)始我們需要查找待研究的晶體所屬的空間群、晶格常數(shù)，這樣建出來(lái)的晶體是有空間群性質(zhì)限制的，即α、β、γ是固定的。 現(xiàn)在有一下幾個(gè)問(wèn)題： 其一，晶體建好以后，用CASTEP做幾何優(yōu)化，勾選optimize cell， 是不是優(yōu)化后，a、b、c的數(shù)值會(huì)變，但是角度α、β、γ不會(huì)變呢？ 其二，晶體建好以后，Make P1，用CASTEP做幾何優(yōu)化，勾選optimize cell， 是不是優(yōu)化后，不僅a、b、c的數(shù)值會(huì)變，而且角度α、β、γ也會(huì)變呢？ 其三，因?yàn)榫w幾何優(yōu)化會(huì)影響到后續(xù)的slab模型，那么用CASTEP做表面吸附時(shí)，晶體幾何的幾何優(yōu)化，到底需不需要make P1呢？ 其四，有位同學(xué)告訴我，即使make P1后，角度α、β、γ(假設(shè)初始α=β=γ=90°)會(huì)變化，但是正確的幾何優(yōu)化結(jié)果，經(jīng)過(guò)若干次迭代后，還是α=β=γ=90°，這個(gè)說(shuō)法對(duì)嗎？ 其五，用DMol3做幾何優(yōu)化，不勾選Use Symmetry做幾何優(yōu)化，是不是效果相當(dāng)于make P1了？ 問(wèn)題比較多，請(qǐng)大家?guī)蛶兔Γ∪f(wàn)分感謝！ |
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學(xué)習(xí)了。 4樓2012-12-11 17:30:23
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fzx2008: 金幣+5, 謝謝指教！ 2012-12-12 12:48:35
apollosun9283: 金幣+100, ★★★★★最佳答案 2012-12-12 12:26:27
fzx2008: 金幣+5, 謝謝指教！ 2012-12-12 12:48:35
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其一，晶體建好以后，用CASTEP做幾何優(yōu)化，勾選optimize cell， 是不是優(yōu)化后，a、b、c的數(shù)值會(huì)變，但是角度α、β、γ不會(huì)變呢？ 答：用CASTEP對(duì)晶體進(jìn)行幾何優(yōu)化，必須選中optimize cell。 若保持原有對(duì)稱(chēng)性不變的前提下，優(yōu)化過(guò)程中，a、b、c的數(shù)值會(huì)發(fā)生改變并最終分別收斂到某值，但是在整個(gè)優(yōu)化過(guò)程中角度α、β、γ保持不變。 其二，晶體建好以后，Make P1，用CASTEP做幾何優(yōu)化，勾選optimize cell， 是不是優(yōu)化后，不僅a、b、c的數(shù)值會(huì)變，而且角度α、β、γ也會(huì)變呢？ 答：若將晶胞對(duì)稱(chēng)性設(shè)為P1，則在優(yōu)化過(guò)程中，a、b、c和α、β、γ的數(shù)值都會(huì)發(fā)生改變并最終分別收斂到某值，具體收斂程度及最終數(shù)值與計(jì)算精度和采用的優(yōu)化函數(shù)等有關(guān)。 其三，因?yàn)榫w幾何優(yōu)化會(huì)影響到后續(xù)的slab模型，那么用CASTEP做表面吸附時(shí)，晶體幾何的幾何優(yōu)化，到底需不需要make P1呢？ 答：make P1的作用是降低晶胞的對(duì)稱(chēng)性，但是不改變晶胞的周期性。其目的是在優(yōu)化過(guò)程中能夠按能量最低原理找出晶胞中具體原子的最可能存在的由對(duì)稱(chēng)性決定的位置，所以選擇make P1通常用于晶胞結(jié)構(gòu)變化較大的情況（如摻雜、替換原子等）。 其四，有位同學(xué)告訴我，即使make P1后，角度α、β、γ(假設(shè)初始α=β=γ=90°)會(huì)變化，但是正確的幾何優(yōu)化結(jié)果，經(jīng)過(guò)若干次迭代后，還是α=β=γ=90°，這個(gè)說(shuō)法對(duì)嗎？ 答：該說(shuō)法基本是準(zhǔn)確的，但有些提法不嚴(yán)謹(jǐn)，“正確的幾何優(yōu)化結(jié)果”這種說(shuō)法就不嚴(yán)謹(jǐn)，沒(méi)有絕對(duì)正確，只有相對(duì)正確。 其五，用DMol3做幾何優(yōu)化，不勾選Use Symmetry做幾何優(yōu)化，是不是效果相當(dāng)于make P1了？ 答：基本相同。 |
3樓2012-12-11 10:57:06
5樓2015-04-24 15:18:39
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