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apollosun9283金蟲 (小有名氣)
劍橋公爵
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[求助]
CASTEP和DMo3l做離子型晶體幾何優(yōu)化的問題
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一般說來,做晶體的表面吸附,首先需要對(duì)晶體進(jìn)行幾何優(yōu)化,然后切面建slab模型。 為此,最開始我們需要查找待研究的晶體所屬的空間群、晶格常數(shù),這樣建出來的晶體是有空間群性質(zhì)限制的,即α、β、γ是固定的。 現(xiàn)在有一下幾個(gè)問題: 其一,晶體建好以后,用CASTEP做幾何優(yōu)化,勾選optimize cell, 是不是優(yōu)化后,a、b、c的數(shù)值會(huì)變,但是角度α、β、γ不會(huì)變呢? 其二,晶體建好以后,Make P1,用CASTEP做幾何優(yōu)化,勾選optimize cell, 是不是優(yōu)化后,不僅a、b、c的數(shù)值會(huì)變,而且角度α、β、γ也會(huì)變呢? 其三,因?yàn)榫w幾何優(yōu)化會(huì)影響到后續(xù)的slab模型,那么用CASTEP做表面吸附時(shí),晶體幾何的幾何優(yōu)化,到底需不需要make P1呢? 其四,有位同學(xué)告訴我,即使make P1后,角度α、β、γ(假設(shè)初始α=β=γ=90°)會(huì)變化,但是正確的幾何優(yōu)化結(jié)果,經(jīng)過若干次迭代后,還是α=β=γ=90°,這個(gè)說法對(duì)嗎? 其五,用DMol3做幾何優(yōu)化,不勾選Use Symmetry做幾何優(yōu)化,是不是效果相當(dāng)于make P1了? 問題比較多,請(qǐng)大家?guī)蛶兔!萬分感謝! |
計(jì)算MS等 | 第一性學(xué)習(xí) |

鐵蟲 (初入文壇)
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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其一,晶體建好以后,用CASTEP做幾何優(yōu)化,勾選optimize cell, 是不是優(yōu)化后,a、b、c的數(shù)值會(huì)變,但是角度α、β、γ不會(huì)變呢? 答:用CASTEP對(duì)晶體進(jìn)行幾何優(yōu)化,必須選中optimize cell。 若保持原有對(duì)稱性不變的前提下,優(yōu)化過程中,a、b、c的數(shù)值會(huì)發(fā)生改變并最終分別收斂到某值,但是在整個(gè)優(yōu)化過程中角度α、β、γ保持不變。 其二,晶體建好以后,Make P1,用CASTEP做幾何優(yōu)化,勾選optimize cell, 是不是優(yōu)化后,不僅a、b、c的數(shù)值會(huì)變,而且角度α、β、γ也會(huì)變呢? 答:若將晶胞對(duì)稱性設(shè)為P1,則在優(yōu)化過程中,a、b、c和α、β、γ的數(shù)值都會(huì)發(fā)生改變并最終分別收斂到某值,具體收斂程度及最終數(shù)值與計(jì)算精度和采用的優(yōu)化函數(shù)等有關(guān)。 其三,因?yàn)榫w幾何優(yōu)化會(huì)影響到后續(xù)的slab模型,那么用CASTEP做表面吸附時(shí),晶體幾何的幾何優(yōu)化,到底需不需要make P1呢? 答:make P1的作用是降低晶胞的對(duì)稱性,但是不改變晶胞的周期性。其目的是在優(yōu)化過程中能夠按能量最低原理找出晶胞中具體原子的最可能存在的由對(duì)稱性決定的位置,所以選擇make P1通常用于晶胞結(jié)構(gòu)變化較大的情況(如摻雜、替換原子等)。 其四,有位同學(xué)告訴我,即使make P1后,角度α、β、γ(假設(shè)初始α=β=γ=90°)會(huì)變化,但是正確的幾何優(yōu)化結(jié)果,經(jīng)過若干次迭代后,還是α=β=γ=90°,這個(gè)說法對(duì)嗎? 答:該說法基本是準(zhǔn)確的,但有些提法不嚴(yán)謹(jǐn),“正確的幾何優(yōu)化結(jié)果”這種說法就不嚴(yán)謹(jǐn),沒有絕對(duì)正確,只有相對(duì)正確。 其五,用DMol3做幾何優(yōu)化,不勾選Use Symmetry做幾何優(yōu)化,是不是效果相當(dāng)于make P1了? 答:基本相同。 |
榮譽(yù)版主 (文壇精英)
魚大嬸
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專家經(jīng)驗(yàn): +1536 |
金蟲 (正式寫手)
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