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apollosun9283金蟲 (小有名氣)
劍橋公爵
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[求助]
CASTEP和DMo3l做離子型晶體幾何優(yōu)化的問題
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一般說來，做晶體的表面吸附，首先需要對晶體進行幾何優(yōu)化，然后切面建slab模型。 為此，最開始我們需要查找待研究的晶體所屬的空間群、晶格常數(shù)，這樣建出來的晶體是有空間群性質(zhì)限制的，即α、β、γ是固定的。 現(xiàn)在有一下幾個問題： 其一，晶體建好以后，用CASTEP做幾何優(yōu)化，勾選optimize cell， 是不是優(yōu)化后，a、b、c的數(shù)值會變，但是角度α、β、γ不會變呢？ 其二，晶體建好以后，Make P1，用CASTEP做幾何優(yōu)化，勾選optimize cell， 是不是優(yōu)化后，不僅a、b、c的數(shù)值會變，而且角度α、β、γ也會變呢？ 其三，因為晶體幾何優(yōu)化會影響到后續(xù)的slab模型，那么用CASTEP做表面吸附時，晶體幾何的幾何優(yōu)化，到底需不需要make P1呢？ 其四，有位同學告訴我，即使make P1后，角度α、β、γ(假設初始α=β=γ=90°)會變化，但是正確的幾何優(yōu)化結(jié)果，經(jīng)過若干次迭代后，還是α=β=γ=90°，這個說法對嗎？ 其五，用DMol3做幾何優(yōu)化，不勾選Use Symmetry做幾何優(yōu)化，是不是效果相當于make P1了？ 問題比較多，請大家?guī)蛶兔Γ∪f分感謝！ |
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8樓2018-07-21 11:45:08
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2樓2012-12-11 10:06:26
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apollosun9283: 金幣+100, ★★★★★最佳答案 2012-12-12 12:26:27
fzx2008: 金幣+5, 謝謝指教！ 2012-12-12 12:48:35
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其一，晶體建好以后，用CASTEP做幾何優(yōu)化，勾選optimize cell， 是不是優(yōu)化后，a、b、c的數(shù)值會變，但是角度α、β、γ不會變呢？ 答：用CASTEP對晶體進行幾何優(yōu)化，必須選中optimize cell。 若保持原有對稱性不變的前提下，優(yōu)化過程中，a、b、c的數(shù)值會發(fā)生改變并最終分別收斂到某值，但是在整個優(yōu)化過程中角度α、β、γ保持不變。 其二，晶體建好以后，Make P1，用CASTEP做幾何優(yōu)化，勾選optimize cell， 是不是優(yōu)化后，不僅a、b、c的數(shù)值會變，而且角度α、β、γ也會變呢？ 答：若將晶胞對稱性設為P1，則在優(yōu)化過程中，a、b、c和α、β、γ的數(shù)值都會發(fā)生改變并最終分別收斂到某值，具體收斂程度及最終數(shù)值與計算精度和采用的優(yōu)化函數(shù)等有關(guān)。 其三，因為晶體幾何優(yōu)化會影響到后續(xù)的slab模型，那么用CASTEP做表面吸附時，晶體幾何的幾何優(yōu)化，到底需不需要make P1呢？ 答：make P1的作用是降低晶胞的對稱性，但是不改變晶胞的周期性。其目的是在優(yōu)化過程中能夠按能量最低原理找出晶胞中具體原子的最可能存在的由對稱性決定的位置，所以選擇make P1通常用于晶胞結(jié)構(gòu)變化較大的情況（如摻雜、替換原子等）。 其四，有位同學告訴我，即使make P1后，角度α、β、γ(假設初始α=β=γ=90°)會變化，但是正確的幾何優(yōu)化結(jié)果，經(jīng)過若干次迭代后，還是α=β=γ=90°，這個說法對嗎？ 答：該說法基本是準確的，但有些提法不嚴謹，“正確的幾何優(yōu)化結(jié)果”這種說法就不嚴謹，沒有絕對正確，只有相對正確。 其五，用DMol3做幾何優(yōu)化，不勾選Use Symmetry做幾何優(yōu)化，是不是效果相當于make P1了？ 答：基本相同。 |
3樓2012-12-11 10:57:06
fds329
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魚大嬸
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學習了。 4樓2012-12-11 17:30:23
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