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cai3110274木蟲 (職業(yè)作家)
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[求助]
求助關(guān)于real-time PCR 內(nèi)參選擇問題
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| 我看到很多文獻(xiàn)上說 現(xiàn)在 國外的雜志都要求兩個或以上的內(nèi)參基因來校正,我想了解下 如果選擇兩個不同內(nèi)參,那么分析的時候以哪個為準(zhǔn)呢 還是兩個都要?還是有什么比較的方法?求解 |

木蟲 (小有名氣)
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我們實(shí)驗(yàn)室里所選的是biorad的實(shí)驗(yàn)和分析系統(tǒng),軟件中可以把兩個內(nèi)參都加上然后再作圖,但貌似不能導(dǎo)入其他系統(tǒng)的數(shù)據(jù)…… 選擇不同的內(nèi)參,我所遇到的主要的情況就是細(xì)胞刺激后,內(nèi)參基因也隨之發(fā)生變化,從而導(dǎo)致內(nèi)參不再具有參考性,因此選擇多個內(nèi)參來降低這種效應(yīng)。 多內(nèi)參的選擇一定要有所區(qū)分,不要一個actin一個tubulin,這樣是沒有意義的,我在選擇內(nèi)參時,會選actin,18s rRNA以及GAPDH中的2個,主要是基于這3個內(nèi)參基因代表了細(xì)胞內(nèi)3種不同的功能。當(dāng)然你也可以去查一些文獻(xiàn),有人專門對內(nèi)參基因的選擇做了研究。 如果有能力,還是上蛋白水平吧,除非miRNA之類的,否則realtime還是會有坑人的地方的,畢竟蛋白的半衰期、翻譯后修飾才是真正體現(xiàn)蛋白在細(xì)胞內(nèi)的活性,跟RNA的水平還是會有些差異的 |
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