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xiaoluoerer新蟲 (初入文壇)
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[求助]
急！NCBI的使用和進(jìn)化樹構(gòu)建求助
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做真菌的鑒定，拿到測序（ITS序列）結(jié)果后遇到一系列問題，麻煩各位大神耐心解答，不甚感激��！ 1.有的測序結(jié)果在ncbi上比對(duì)后發(fā)現(xiàn)和我用形態(tài)學(xué)鑒定的結(jié)果相差很遠(yuǎn)，屬都不一樣，選取的是ncbi上同源性99%以上的菌，而且我能很肯定形態(tài)學(xué)鑒定的結(jié)果是正確的，這是否是測序公司的問題？ 2.在ncbi上比對(duì)發(fā)現(xiàn)我的序列和上面的序列反向互補(bǔ)，我要構(gòu)建進(jìn)化樹，那下載下來的序列該怎么處理或是我的序列需要處理？ 3.我有二十幾種菌，有的是同屬，有的不同屬，構(gòu)建進(jìn)化樹時(shí)是否需要下載下來的參考菌還是用我的二十幾種？ 4.序列上傳到genebank是直接將測序彩圖校對(duì)過的序列上傳還是在ncbi上比對(duì)之后用clustal比對(duì)，修正過的序列上傳？ |
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