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WJ-MS新蟲 (小有名氣)
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[求助]
LAMMPS運行結(jié)果出現(xiàn)nan
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改寫了一段小的程序，運行計算的時候，屏幕上熱力學輸出都只顯示nan，見附圖，這是怎么回事阿？ Screenshot.png |
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9樓2012-12-09 22:19:11
WJ-MS2樓2012-12-07 14:04:29
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【答案】應(yīng)助回帖
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初始構(gòu)型的問題，在run之前先minimize一下。 http://lammps.sandia.gov/doc/minimize.html |
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3樓2012-12-08 04:58:17
tracel
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3d NaCl melt units metal dimension 3 boundary p p p atom_style charge region regbox block 0 18.8 0 18.8 0 18.8 units box create_box 2 regbox create_atoms 1 random 106 16 regbox units box create_atoms 2 random 106 16 regbox units box mass 1 23.0 mass 2 35.5 set type 1 charge 1.0 set type 2 charge -1.0 pair_style born/coul/long 10.0 8.0 pair_coeff 1 1 0.2640625 0.317 2.340 1.05 0.5 pair_coeff 1 2 0.21125 0.317 2.755 7 8.6875 pair_coeff 2 2 0.1584375 0.317 3.170 72.5 145.625 kspace_style ewald 1.0e-5 neighbor 0.1 bin neigh_modify every 5 delay 0 check no timestep 0.005 compute 1 all msd velocity all create 1073.0 87287 dist gaussian run 0 thermo 5000 thermo_style custom step etotal temp c_1[4] thermo_modify flush yes dump 1 all custom 100000 dump.* id type x y z dump 2 all cfg 100000 a*.cfg id type xs ys zs dump_modify 1 element Na1 Cl2 fix 1 all npt temp 1073 1073 4 aniso 0 0 4 run 500000 unfix 1 fix 1 all nvt temp 1073 1073 0.1 drag 0.2 run 500000 |
5樓2012-12-09 21:28:05
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7樓2012-12-09 21:30:56
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10樓2012-12-09 23:14:20
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