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夢里曉詩金蟲 (小有名氣)
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[求助]
使用antechamber生成resp電荷時(shí)報(bào)錯(cuò)
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請教各位大神，自學(xué)AMBER很抓狂啊。。。 想得到一個(gè)分子的resp電荷信息。之前用gaussian09先生成了*.log文件。輸入文件為 hf/6-31g* SCA=tight Test Pop=MK iop(6/33=2) iop(6/42=6) 使用AMBER進(jìn)行轉(zhuǎn)化的時(shí)候報(bào)錯(cuò)，輸入命令為 /antechamber -i *.log -fi gout -o *.mol2 -fo mol2 -c resp 出錯(cuò)信息如下 Info: Bond types are assigned for valence state 1 with penalty of 1 Info: the number of the ESP exceeds the MAXESP(20000),extend the size and reallocate the memory automatically Amber 9 RESP Unit 10 Error on OPEN: ANTECHAMBER.ESP Error: cannot run "resp -O -i ANTECHAMBER_RESP1.IN -o ANTECHAMBER_RESP1.OUT -e ANTECHAMBER.ESP -t qout" in resp() of charge.c properly, exit 另外，很想求助、我的體系有四、五十個(gè)原子，請問用resp電荷計(jì)算和bcc電荷計(jì)算差別有多大呢？因?yàn)橐恢眗esp電荷一直轉(zhuǎn)化不出來，而bcc電荷可以得到。如果區(qū)別不是很大的話，就直接用bcc電荷算了。。折騰的我快折壽了。。。。 跪求指導(dǎo)。。。。  [ Last edited by 夢里曉詩 on 2012-12-17 at 16:31 ] |
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 amber |
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139564@chen
金蟲 (小有名氣)
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
夢里曉詩: 金幣+1, 謝謝啊，但是我的體系是中性的，而且沒有重原子，都是C、H、O、N 2012-12-17 16:58:03
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
夢里曉詩: 金幣+1, 謝謝啊，但是我的體系是中性的，而且沒有重原子，都是C、H、O、N 2012-12-17 16:58:03
| 可以參考一下這篇帖子 http://www.bioms.org/thread-125-1-2.html |
2樓2012-12-17 16:51:46
3樓2012-12-17 21:47:06
4樓2012-12-17 21:50:05
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