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[求助]
目的基因連接到克隆載體后提取質(zhì)粒測(cè)序,序列有問題
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| 蟲友們幫幫忙,我以質(zhì)粒為模板進(jìn)行PCR,之后連接到T載體上,轉(zhuǎn)化入大腸桿菌中,提取質(zhì)粒,雙酶切鑒定,但是幾個(gè)菌落酶切后的目的基因片段大小有點(diǎn)差別,有750bp的,有700bp左右的,還有650bp左右的。我就將這三個(gè)都拿去測(cè)序,結(jié)果750bp的是我要的序列,但是另外兩個(gè)稍微短一些的序列也是我的序列,只不過中間分別少了十幾個(gè)和二十幾個(gè)氨基酸,其它的氨基酸序列都與正確的序列是一樣的。怎么會(huì)發(fā)生這種情況呢?難道在大腸桿菌中發(fā)生剪接了,剪掉了一些氨基酸?有蟲友碰到過這種情況嗎? |
分子生化實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)積累 | 重復(fù)序列PCR擴(kuò)增 |


榮譽(yù)版主 (著名寫手)
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專家經(jīng)驗(yàn): +24 |
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首先,指出你描述問題的錯(cuò)誤的地方, “只不過中間分別少了十幾個(gè)和二十幾個(gè)氨基酸,其它的氨基酸序列都與正確的序列是一樣的!边@里不是氨基酸序列,你描述的應(yīng)該是核苷酸序列 “難道在大腸桿菌中發(fā)生剪接了,剪掉了一些氨基酸?”這里同樣應(yīng)是核苷酸序列。 “有750bp的,有700bp左右的,還有650bp左右的”,“結(jié)果750bp的是我要的序列,但是另外兩個(gè)稍微短一些的序列也是我的序列,只不過中間分別少了十幾個(gè)和二十幾個(gè)氨基酸,其它的氨基酸序列都與正確的序列是一樣的。” 據(jù)你描述這三個(gè)質(zhì)粒應(yīng)該都是你的引物擴(kuò)增出來的,但有兩個(gè)出現(xiàn)了兩個(gè)質(zhì)粒中間缺少一段序列的情況,我覺得你的序列中可能存在重復(fù)序列,然后PCR后,會(huì)少一個(gè)重復(fù),你分析下你的序列,看看是不是我說的這種情況,也就是找下你的序列中有沒有一段是重復(fù)序列。 |

銅蟲 (初入文壇)
鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)
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