版塊導(dǎo)航: 正在加載中...

登錄注冊

應(yīng)《網(wǎng)絡(luò)安全法》要求，自2017年10月1日起，未進(jìn)行實名認(rèn)證將不得使用互聯(lián)網(wǎng)跟帖服務(wù)。為保障您的帳號能夠正常使用，請盡快對帳號進(jìn)行手機(jī)號驗證，感謝您的理解與支持！

24小時熱門版塊排行榜

北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

返回列表

zongzhiyou

銀蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 305.1
紅花: 1
帖子: 33
在線: 19.1小時
蟲號: 1343693
注冊: 2011-07-12
性別: GG
專業(yè): 微生物生理與生物化學(xué)

[求助] 求教N(yùn)AMD安裝的問題

各位大俠，請教一個比較弱弱的問題：
關(guān)于NAMD軟件的安裝，在官網(wǎng)上找到NAMD下載網(wǎng)頁中列表如下
在Version 2.9 (2012-04-30) Platforms中有以下選項：
Linux-x86 (32-bit Intel/AMD with ethernet)
Linux-x86-TCP (TCP may be better on gigabit)
Linux-x86_64-multicore (64-bit Intel/AMD single node)
Linux-x86_64 (64-bit Intel/AMD with ethernet)
Linux-x86_64-TCP (TCP may be better on gigabit)
Linux-x86_64-ibverbs (InfiniBand via OpenFabrics OFED, no MPI needed)
Linux-x86_64-ibverbs-smp (InfiniBand plus shared memory, no MPI needed)
Linux-x86_64-multicore-CUDA (NVIDIA CUDA acceleration)
Linux-x86_64-ibverbs-smp-CUDA (NVIDIA CUDA with InfiniBand)
MacOSX-x86 (Mac OS X for Intel processors, fails on 10.7 "Lion"

MacOSX-x86_64 (Mac OS X for 64-bit Intel processors)
Solaris-x86_64
Win32 (Windows XP, etc.)
Win64-MPI (Windows HPC Server)
Source Code
目前我的是XP 32bit 選擇Win32 (Windows XP, etc.)下載，點(diǎn)擊了namd2.exe提示如附件中的錯誤，在論壇里看到是缺少confi文件，那這個文件哪里去弄，求解答

[ Last edited by zongzhiyou on 2013-1-7 at 12:42 ]

回復(fù)此樓

» 收錄本帖的淘帖專輯推薦

NAMD

» 猜你喜歡

求調(diào)劑已經(jīng)有7人回復(fù)
272求調(diào)劑已經(jīng)有7人回復(fù)
352分化工與材料已經(jīng)有3人回復(fù)
0703化學(xué) 已經(jīng)有6人回復(fù)
一志愿南昌大學(xué)324求調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)
求調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)
266分求材料化工冶金礦業(yè)等專業(yè)的調(diào)劑已經(jīng)有4人回復(fù)
一志愿南師大0703化學(xué) 275求調(diào)劑已經(jīng)有4人回復(fù)
085701環(huán)境工程求調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)
266求調(diào)劑已經(jīng)有10人回復(fù)

» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:

求助關(guān)于namd中能量優(yōu)化的一點(diǎn)疑問已經(jīng)有6人回復(fù)
求助namd的配置文件的修改，主要是如何添加約束已經(jīng)有5人回復(fù)
求教，安裝過程出現(xiàn)配置文件錯誤已經(jīng)有2人回復(fù)
請教GROMACS安裝已經(jīng)有8人回復(fù)
本科新手，NAMD 做分子模擬，學(xué)習(xí)受阻，求教~~ 已經(jīng)有3人回復(fù)
安裝aspen過程中遇到問題求教高手已經(jīng)有8人回復(fù)
[新手求教]安裝Gromacs后，查看pdb2gmx命令，顯示無此命令已經(jīng)有9人回復(fù)
【求助】在NAMD運(yùn)行中使用CHARMM格式的力場文件，但力場參數(shù)來自AMBER力場，會出問題?/a> 已經(jīng)有4人回復(fù)

求教，我安裝的merck14th，前面使用幾天ok，但是現(xiàn)在不行了已經(jīng)有7人回復(fù)
【求助】做NAMD的1K4C.pdb時候出現(xiàn)的錯誤已經(jīng)有30人回復(fù)
【求助】NAMD: water box時，立方水體的邊界該怎樣確定？先謝了已經(jīng)有4人回復(fù)
【求助】NAMD中的segment是什么意思？已經(jīng)有3人回復(fù)
【求助】LAMMPS、NAMD和CHARMM誰最適合生物大分子模擬？已經(jīng)有8人回復(fù)
【求助】Gromacs和NAMD比Amber快很多嗎？如何選擇？已經(jīng)有7人回復(fù)
【求助】打算從amber學(xué)起已經(jīng)有16人回復(fù)
【求助】namd 出錯Periodic cell has become too small for original patch grid! 已經(jīng)有10人回復(fù)
【求助】Linux 下NAMD的單機(jī)版怎么安裝？已經(jīng)有6人回復(fù)
【求助】NAMD和Gromacs哪個簡單？已經(jīng)有5人回復(fù)
【求助】namd和vmd就只能識別.pdb.psf.coor.vel等文件嗎已經(jīng)有6人回復(fù)
【求助】namd、vmd推薦個學(xué)習(xí)修改和編寫腳本網(wǎng)站和地方吧已經(jīng)有3人回復(fù)
【求助】namd tutorial遇到問題已經(jīng)有10人回復(fù)
【求助】NAMD安裝問題已經(jīng)有19人回復(fù)

來自他鄉(xiāng)

1樓 2013-01-07 11:11:09

已閱關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

fhh2626

木蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 135 (高中生)
金幣: 2354.1
紅花: 7
帖子: 344
在線: 139小時
蟲號: 1475956
注冊: 2011-11-04
性別: GG
專業(yè): 理論和計算化學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
jiaoyixiong: 金幣+2, 鼓勵交流 2013-01-07 20:20:06

本來NAMD就沒有圖形界面的，不能點(diǎn)開
CONF文件是要自己寫的，里面包含了你要計算的體系的各種信息
寫完了之后用namd2 **.conf > **.log這類似的命令來進(jìn)行計算
關(guān)于這個文件怎么寫你可以看一下這個貼
http://www.gaoyang168.com/html/201108/3516164.html

贊一下

回復(fù)此樓

2樓2013-01-07 13:53:57