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luocongqiang

鐵蟲(chóng) (小有名氣)

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[求助] 測(cè)序比對(duì)結(jié)果

我提取了兩株束絲藻基因，用27F和1492R這對(duì)引物PCR后測(cè)序、NCBI比對(duì)的結(jié)果是魚(yú)腥藻，不知道為什么結(jié)果不是束絲藻，謝謝大家

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1樓 2013-01-13 22:13:06

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mizhoulong

木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

環(huán)境衛(wèi)生、微生物學(xué)

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

27F和1492R不是16S rDNA的通用引物？原核的？

你這兩株兩株束絲藻是真核的吧？

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環(huán)境衛(wèi)生、微生物學(xué)、衛(wèi)生應(yīng)急

3樓2013-01-15 00:58:21

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cicelyzh

鐵桿木蟲(chóng) (職業(yè)作家)

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

你做的這兩株藻種在NCBI的數(shù)據(jù)庫(kù)里面有序列嗎？此外，會(huì)不會(huì)是樣品提取時(shí)候有污染？

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2樓2013-01-14 03:09:52

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mlanqiang

木蟲(chóng)之王 (文學(xué)泰斗)

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【答案】應(yīng)助回帖

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你的這兩株可能不是真核的。。。

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藍(lán)精靈

4樓2013-01-15 08:33:09

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luocongqiang

鐵蟲(chóng) (小有名氣)

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引用回帖:

2樓: Originally posted by cicelyzh at 2013-01-14 03:09:52
你做的這兩株藻種在NCBI的數(shù)據(jù)庫(kù)里面有序列嗎？此外，會(huì)不會(huì)是樣品提取時(shí)候有污染？

如果數(shù)據(jù)庫(kù)中沒(méi)有是否比對(duì)結(jié)果也應(yīng)該是同一屬的呢，為什么是另一屬呢，污染不知道有沒(méi)有，但在顯微鏡下形態(tài)學(xué)上看應(yīng)該是束絲藻，謝謝你問(wèn)題

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5樓2013-01-15 15:08:10

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普通表情龍兔虎貓

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