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suanguozi

新蟲(chóng) (初入文壇)

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[求助] 求助，系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

分子實(shí)驗(yàn)測(cè)序后的序列在NCBI上比對(duì)后，找到其近緣種，請(qǐng)問(wèn)大家這個(gè)近緣種的來(lái)源怎么找啊，老師急著要，可愁死我了，一堆英文看不懂啊，大家?guī)蛶兔�，謝謝啦

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1樓 2013-01-18 21:37:39

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螺旋的歌

銅蟲(chóng) (初入文壇)

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【答案】應(yīng)助回帖

既然都比對(duì)了，在BLAST出來(lái)的結(jié)果中，找7-8條序列的相似高的序列(MAX IDENT數(shù)值高的序列，注意不要選到人工合成的序列)，然后載下來(lái)，在用MEGA建樹(shù)吧。

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5樓2013-03-14 23:34:14

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suanguozi

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大家?guī)蛶兔Π�，不勝感激�?

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2樓2013-01-18 21:39:13

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蜂火戲豬猴

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★
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zhang8826857: 金幣+3, 鼓勵(lì)新蟲(chóng) 2013-01-19 21:15:43

來(lái)源？點(diǎn)開(kāi)那個(gè)菌株的鏈接都應(yīng)該有的啊，包括上傳人、來(lái)源、日期等很多信息啊！找個(gè)英語(yǔ)好的幫看看就行了！

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3樓2013-01-19 10:26:51

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weebug

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【答案】應(yīng)助回帖

★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zhang8826857: 金幣+1, 鼓勵(lì)應(yīng)助 2013-01-19 21:15:37

看NCBI比對(duì)列表里有什么近緣種，比如出現(xiàn)最多的列，或在測(cè)序前就已被告知的物種。。

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天藍(lán)藍(lán)兮日頭曬

4樓2013-01-19 19:03:09

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普通表情龍兔虎貓

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