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summer2771木蟲 (正式寫手)
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[交流]
WB的蛋白總量，變還是不變��？ 已有4人參與
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請教大家的意見，經(jīng)�？梢钥吹秸撐闹校ò▽W(xué)位論文），只做某些蛋白的磷酸化表達(dá)，而不做蛋白總量表達(dá)。是否可以理解為，某蛋白的總量跟內(nèi)參一樣，是相對恒定不變的，即便是有波動，但也并無顯著性差異。由此則只要計(jì)算出磷酸化表達(dá)的相對量即可說明磷酸化率究竟是上升還是下調(diào)，從而表明該蛋白的變化。 我的實(shí)驗(yàn)中出現(xiàn)了有好多例都是各個(gè)組的蛋白總量也是有顯著不同的，磷酸化表達(dá)也是不同的，我用磷酸化表達(dá)/總量表達(dá)的Ratio來說明問題，出現(xiàn)的趨勢卻可能是跟磷酸化、總量本身的變化趨勢相反，即磷酸化、總量均上升，但是Ratio卻可能是下調(diào)的。 看國外國內(nèi)很多的論文，從條帶上來看，基本上總量似乎是沒有差異的。 我就有點(diǎn)納悶了，難道我的實(shí)驗(yàn)出現(xiàn)了問題？ |
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謝謝各位戰(zhàn)友的熱心回復(fù)！ 我是同時(shí)做了磷酸化與蛋白總量的，但是發(fā)現(xiàn)有個(gè)問題，就是我的蛋白總量也是變化的，而且具有顯著性的差異，磷酸化也是有變化的，比如：某一個(gè)蛋白的蛋白總量，實(shí)驗(yàn)組與對照組相比，是升高的；磷酸化表達(dá)的相對倍數(shù)也是升高的；但是用磷酸化表達(dá)/蛋白總量后，比值卻是下降的.... 有朋友告訴我說，一般總量是不變，即變化比較小，沒有顯著性差異，倍數(shù)來看，可能是1.0幾或者是0.9幾倍，統(tǒng)計(jì)出來的結(jié)果是p大于0.05的。我看過的論文中，做了磷酸化與總量的，從條帶來看，都是比較齊的，看不出會有顯著性的差異。這是我比較納悶的地方。畢竟磷酸化表達(dá)只是蛋白表達(dá)中很小的一部分，所以即便是磷酸化表達(dá)有變化，總量應(yīng)該是相對較為恒定，沒有顯著性升高或降低的。 |
5樓2013-01-25 11:12:31
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