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summer2771木蟲 (正式寫手)
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[交流]
WB的蛋白總量，變還是不變�。� 已有4人參與
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請教大家的意見，經(jīng)常可以看到論文中（包括學位論文），只做某些蛋白的磷酸化表達，而不做蛋白總量表達。是否可以理解為，某蛋白的總量跟內(nèi)參一樣，是相對恒定不變的，即便是有波動，但也并無顯著性差異。由此則只要計算出磷酸化表達的相對量即可說明磷酸化率究竟是上升還是下調(diào)，從而表明該蛋白的變化。 我的實驗中出現(xiàn)了有好多例都是各個組的蛋白總量也是有顯著不同的，磷酸化表達也是不同的，我用磷酸化表達/總量表達的Ratio來說明問題，出現(xiàn)的趨勢卻可能是跟磷酸化、總量本身的變化趨勢相反，即磷酸化、總量均上升，但是Ratio卻可能是下調(diào)的。 看國外國內(nèi)很多的論文，從條帶上來看，基本上總量似乎是沒有差異的。 我就有點納悶了，難道我的實驗出現(xiàn)了問題？ |
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謝謝各位戰(zhàn)友的熱心回復(fù)！ 我是同時做了磷酸化與蛋白總量的，但是發(fā)現(xiàn)有個問題，就是我的蛋白總量也是變化的，而且具有顯著性的差異，磷酸化也是有變化的，比如：某一個蛋白的蛋白總量，實驗組與對照組相比，是升高的；磷酸化表達的相對倍數(shù)也是升高的；但是用磷酸化表達/蛋白總量后，比值卻是下降的.... 有朋友告訴我說，一般總量是不變，即變化比較小，沒有顯著性差異，倍數(shù)來看，可能是1.0幾或者是0.9幾倍，統(tǒng)計出來的結(jié)果是p大于0.05的。我看過的論文中，做了磷酸化與總量的，從條帶來看，都是比較齊的，看不出會有顯著性的差異。這是我比較納悶的地方。畢竟磷酸化表達只是蛋白表達中很小的一部分，所以即便是磷酸化表達有變化，總量應(yīng)該是相對較為恒定，沒有顯著性升高或降低的。 |
5樓2013-01-25 11:12:31
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