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dayanxiang木蟲 (正式寫手)
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[求助]
細菌親緣關(guān)系疑問
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| 請問同一種不同菌株的16S rDNA 序列有沒有可能相似性只有87%？通常情況下沒有，有沒有特例，比如某些功能類群，非常感謝！ |
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dayanxiang
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【答案】應(yīng)助回帖
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一般情況下，同一種，不同菌株之間的差異絕對 不會超過4%！ 因為按照國際上的菌種分類學(xué)來講，當兩個菌株的16S rDNA的blast差異性超過了4%的時候，我們就可以進行生理生化測定，判定該菌株是否是新的小種。如果超過了8%的時候，基本上就可以判定兩個菌株不是同一個小種。如果超過了10%，我們就會認為是其他小種，兩個菌株之間的差異性橫豎不可能超過4%。這個基本上是一個默認的規(guī)矩。 |
3樓2013-03-20 08:31:10
lmhzy1987
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4樓2013-03-20 21:20:58
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