 |
 |
 |
| 24小時(shí)熱門版塊排行榜 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2821 | 回復(fù): 10 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
yida木蟲(chóng) (小有名氣)
|
[求助]
MS Discover 動(dòng)力學(xué)求助 已有1人參與
|
||
|
我做小分子在水體系中對(duì)金屬表面的吸附模型，如下圖，建好模型結(jié)構(gòu)優(yōu)化后進(jìn)行了2ns 的NVT后進(jìn)行了5ns的NVE，但是NVE任務(wù)失敗，能量波動(dòng)閾值采取默認(rèn)5000，提示能量波動(dòng)過(guò)大。 有以下問(wèn)題請(qǐng)高手解惑： 體系建的正確的話是不是NVT NVE NPT系綜都能運(yùn)行？也就是說(shuō)采用以上三種模型優(yōu)化失敗的話就是模型有問(wèn)題？ 為什么結(jié)構(gòu)優(yōu)化后進(jìn)行NPT，立馬就出錯(cuò)誤信息，說(shuō)能量波動(dòng)值太大，這是什么原因？ 模型.jpg 2ns NVT E-t.jpg 2ns NVT T-t.jpg 5ns NVE E-t.jpg 5ns NVE T-t.jpg |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
266分，求材料相關(guān)專業(yè)調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
材料求調(diào)劑 一志愿哈工大總分298分，前三科223分
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
本科211總分289，08工學(xué)真心求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
085600材料與化工調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
食品工程專碩一志愿中海洋309求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
一志愿中海洋320化學(xué)工程與技術(shù)學(xué)碩求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
材料科學(xué)與工程調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
材料與化工調(diào)劑一志愿大連海事085600，349
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
理學(xué)07化學(xué) 303求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
甲基亞磺磺酸鈉和甲基磺酸酯反應(yīng)機(jī)理
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 求助 MS中discover模塊中建模的問(wèn)題
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 關(guān)于Discover動(dòng)力學(xué)計(jì)算的一個(gè)問(wèn)題
已經(jīng)有26人回復(fù)
- 關(guān)于第一性原理和分子動(dòng)力學(xué)模擬，還有ms軟件
已經(jīng)有9人回復(fù)
- MS金屬氧化物表面吸附有機(jī)物平衡問(wèn)題
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 怎么把Discover動(dòng)力學(xué)完成后的軌跡文件提取出來(lái)？
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助】模擬如何計(jì)算 界面張力？MS
已經(jīng)有21人回復(fù)
- 【求助】MS如何實(shí)現(xiàn)水分子與SiO2反應(yīng)的分子動(dòng)力學(xué)模擬過(guò)程（想得到Si-OH鍵）？
已經(jīng)有21人回復(fù)
- 【求助】MS 中discover模塊跑完動(dòng)力學(xué)，用哪個(gè)模塊可以計(jì)算分析自由能變化
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】請(qǐng)教分子動(dòng)力學(xué)模擬軟件選擇
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】MS 軟件計(jì)算的時(shí)間問(wèn)題
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 【求助】discover 里面怎么分析氫鍵的鍵角和鍵長(zhǎng)分布
已經(jīng)有12人回復(fù)
zmy0714
至尊木蟲(chóng) (職業(yè)作家)
- 應(yīng)助: 21 (小學(xué)生)
- 金幣: 14891.4
- 散金: 4892
- 紅花: 8
- 沙發(fā): 1
- 帖子: 3161
- 在線: 659小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1166841
- 注冊(cè): 2010-12-10
- 性別: GG
- 專業(yè): 高分子材料的加工與成型
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
yida: 金幣+5, ★★★很有幫助 2013-04-19 10:52:01
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
yida: 金幣+5, ★★★很有幫助 2013-04-19 10:52:01
|
先跑NVT,在跑NPT 這樣對(duì)系統(tǒng)的穩(wěn)定性要好一些，也不容易報(bào)錯(cuò) 能量波動(dòng)閾值采取默認(rèn)5000，這個(gè)要改一下， 加大十來(lái)倍（但估計(jì)這個(gè)改動(dòng)對(duì)你的模型意義不大）你的溫度一下子直接上道了2500K ,這里可以嘗試改變溫控方法，通過(guò)控制溫度變化范圍，使溫度收斂。具體是Velocity scale method、還是Nosé and Andersen methods、Berendsen method，自己琢磨下help文件。希望這些能幫到你。 |
3樓2013-04-19 10:24:00
曾一晚
金蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 1015.8
- 紅花: 1
- 帖子: 56
- 在線: 361.7小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1606270
- 注冊(cè): 2012-02-08
- 性別: GG
- 專業(yè): 微/納機(jī)械系統(tǒng)
2樓2013-04-19 10:19:27
sikasun
木蟲(chóng) (正式寫手)
- 應(yīng)助: 15 (小學(xué)生)
- 金幣: 3822.2
- 散金: 696
- 紅花: 1
- 帖子: 800
- 在線: 181.5小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 632362
- 注冊(cè): 2008-10-21
- 性別: MM
- 專業(yè): 環(huán)境污染化學(xué)
4樓2013-04-19 10:25:36
yida
木蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 1209.9
- 紅花: 1
- 帖子: 244
- 在線: 224.8小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1201744
- 注冊(cè): 2011-02-11
- 專業(yè): 微生物藥物
5樓2013-04-19 10:51:17
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 266分，求材料相關(guān)專業(yè)調(diào)劑 +6 | 哇呼哼呼哼 2026-03-30 | 8/400 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 317求調(diào)劑 +8 | 十閑wx 2026-03-24 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿南昌大學(xué)324求調(diào)劑 +9 | hanamiko 2026-03-27 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 367求調(diào)劑 +5 | 芋泥啵啵… 2026-03-28 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 抱歉 +3 | 田洪有 2026-03-30 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿南開(kāi)大學(xué)0710生物學(xué)359求調(diào)劑 +5 | 兔兔兔111223314 2026-03-29 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料化工340求調(diào)劑 +3 | jhx777 2026-03-30 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料專碩 085600求調(diào)劑 +7 | BBQ233 2026-03-30 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 329求調(diào)劑，一志愿西北工業(yè)大學(xué)，材料工程（085601） +5 | 小小機(jī)靈蟲(chóng) 2026-03-29 | 11/550 |
|
|
|
[考研]
 一志愿武漢理工，總分321，英一數(shù)二，求老師收留。
+11
|
nnnnnnn5 2026-03-25 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 081200-314 +3 | LILIQQ 2026-03-27 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 352分 化工與材料 +5 | 海納百川Ly 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 086000調(diào)劑 +3 | 7901117076 2026-03-26 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 085600，材料與化工321分調(diào)劑 +4 | 大饞小子 2026-03-27 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 085601 材料工程 313分 求調(diào)劑 +5 | Ong3 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 314求調(diào)劑 +3 | 溪云珂 2026-03-26 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料與化工304求B區(qū)調(diào)劑 +3 | 邱gl 2026-03-25 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求b區(qū)院校調(diào)劑 +4 | 周56 2026-03-24 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉林大學(xué)材料與化工303分求調(diào)劑 +4 | 為學(xué)666 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 300分，材料，求調(diào)劑，英一數(shù)二 +5 | 超贊的 2026-03-24 | 5/250 |
|