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xinmutian鐵蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
如何用生物信息學(xué)的方法了解新的基因功能
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1、植物全基因組尚未測(cè)序 2、我們做的是轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,現(xiàn)在進(jìn)行到結(jié)果已經(jīng)出來(lái)。那么后來(lái)對(duì)這些差異基因如何進(jìn)行生物信息學(xué)分析 3、研究基因功能一定要把基因轉(zhuǎn)到植株里,然后看表型么? |
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鐵蟲(chóng) (小有名氣)

鐵蟲(chóng) (小有名氣)

銅蟲(chóng) (初入文壇)

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金蟲(chóng) (小有名氣)
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一般來(lái)講, 大概有這么幾件事可以做. 1 顯著變化基因功能分析.即變化非常明顯的基因,無(wú)論上調(diào)下調(diào),都仔細(xì)的區(qū)作功能注釋,并分析這些東西和你的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的關(guān)系. 1 功能分類(lèi),根據(jù)你的試驗(yàn)?zāi)康?對(duì)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中有差異的基因進(jìn)行功能注釋和分類(lèi),來(lái)看對(duì)照和試驗(yàn)組主要存在哪些大的類(lèi)別上的差異. 2 pathway富集, 對(duì)比較清楚上下游的基因,可以分析哪個(gè)通路在你的處理試驗(yàn)中變化較顯著. 所有這些,看書(shū)估計(jì)都會(huì)比較慢,我覺(jué)得還是看看轉(zhuǎn)錄組分析的文章比較快,就照著人家的思路來(lái)就是了. |
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