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xinmutian鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
如何用生物信息學的方法了解新的基因功能
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1、植物全基因組尚未測序 2、我們做的是轉錄組測序，現(xiàn)在進行到結果已經出來。那么后來對這些差異基因如何進行生物信息學分析 3、研究基因功能一定要把基因轉到植株里，然后看表型么？ |
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grape_vine
金蟲 (小有名氣)
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【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★
xinmutian: 金幣+5, ★有幫助, 帖子很久了 2013-05-15 17:43:37
xinmutian: 金幣+5, ★有幫助, 帖子很久了 2013-05-15 17:43:37
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一般來講, 大概有這么幾件事可以做. 1 顯著變化基因功能分析.即變化非常明顯的基因,無論上調下調,都仔細的區(qū)作功能注釋,并分析這些東西和你的實驗設計的關系. 1 功能分類,根據你的試驗目的,對轉錄組數據中有差異的基因進行功能注釋和分類,來看對照和試驗組主要存在哪些大的類別上的差異. 2 pathway富集, 對比較清楚上下游的基因,可以分析哪個通路在你的處理試驗中變化較顯著. 所有這些,看書估計都會比較慢,我覺得還是看看轉錄組分析的文章比較快,就照著人家的思路來就是了. |
7樓2013-05-15 12:27:46
凌波麗
專家顧問 (知名作家)
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- 管轄: 生物科學綜合
【答案】應助回帖
感謝參與，應助指數 +1
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你的問題太大了，我沒有辦法回答，給你本書自己參考吧。 MMB408-Gene Function Analysis,免費下載。 |
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2013-05-06 18:00:07, 5.95 M
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
xinmutian2樓2013-05-06 17:53:54
smile-1215
銅蟲 (初入文壇)
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5樓2013-05-15 08:11:43
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6樓2013-05-15 08:15:34
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