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guochuan104新蟲 (初入文壇)
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為啥總是提不出自然界微生物群落的總DNA
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各位大俠,小妹又來(lái)問啦~ 小妹我最近做的實(shí)驗(yàn)是從載體上收集盡可能多的微生物,提取這些微生物的DNA: 1) 加0.6mL TE懸浮沉淀,并加30µL10%SDS,5µL 20mg/mL蛋白酶K,強(qiáng)烈震蕩至均勻,37℃恒溫反應(yīng)0.5~1h。 3) 加1.5mL5mol/LNaCl溶液,混勻。 4) 加1.5mLCTAB/NaCl溶液,混勻,65℃恒溫靜置20min。 5) 用等體積氯仿:異戊醇(24:1)抽提兩次,輕輕緩慢混勻,8000 r/min, 25℃離心10min,將上清液移至10mL無(wú)菌離心管。 6) 加等體積異丙醇,顛倒混勻,室溫下靜置30min,沉淀DNA。5000r/min離心10min,倒出上層廢液,用70%乙醇漂洗后,吸干,溶于適量的TE,-20℃保存,以備后續(xù)實(shí)驗(yàn)。 第一次我取了0.2g收集的微生物,沉淀時(shí)看到有碎碎的白色碎片,跑膠沒看到DNA,第二次取了0.4g,沉淀時(shí)有白色薄膜,跑膠看到DNA但沒有很亮。中間有別的實(shí)驗(yàn)就把提的DNA放冰箱了三天,昨天用引物338-518做RCR,25ul體系里加4ul模板,35個(gè)循環(huán),跑膠出來(lái)只有引物二聚體!而拿我同門提的養(yǎng)殖場(chǎng)沼渣DNA做對(duì)照也P了,有短片段的條帶,求問這到底是什么問題~ |
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