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[交流]
基因/蛋白進(jìn)化過程中的相關(guān)問題。
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| 在進(jìn)化過程中基因突變是普通的突變?nèi)菀走是插入或缺失突變?nèi)菀??我的理解是普通的突變更容易,插入或缺失突變只有移碼數(shù)為3的整數(shù)倍時(shí)才有可能保留原蛋白的特征,但很可能導(dǎo)致蛋白性能的重大變化,因此進(jìn)化中插入或缺失氨基酸是不是可能為蛋白進(jìn)化的較大分水嶺……希望和大家學(xué)習(xí)交流。。ㄖ饕俏矣龅搅丝赡艿倪M(jìn)化問題,歡迎大俠提供相關(guān)資料或鏈接,不勝感激!。 |
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| 單單從細(xì)胞增殖的過程看,我覺得點(diǎn)突變比插入或者缺失更容易(非病毒之類的感染)。但是基因修復(fù)能力還是很強(qiáng)的,突變率依然非常低。你說“插入或缺失突變只有移碼數(shù)為3的整數(shù)倍時(shí)才有可能保留原蛋白的特征,但很可能導(dǎo)致蛋白性能的重大變化,因此進(jìn)化中插入或缺失氨基酸是不是可能為蛋白進(jìn)化的較大分水嶺”。插入或缺失如果在外顯子內(nèi),可能不影響你最后蛋白的表達(dá),插入或缺失如果在你內(nèi)含子內(nèi),影響你蛋白正確的氨基酸編碼,那么這個(gè)突變必定是致死的(蛋白承擔(dān)重大生理功能,非可有可無或次級(jí)代謝產(chǎn)物的相關(guān)蛋白)。我覺得突變的過程是這樣的,生物體先點(diǎn)突變,這個(gè)突變不能太大影響生物體的正常生理功能,生物體能正常存活下來,然后通過重組遺傳等方式把這個(gè)突變保留下來。外界環(huán)境變化的時(shí)候,篩選有利基因,可能這個(gè)突變的基因能夠被富集。個(gè)人認(rèn)為插入原有蛋白中的片段大多是致死的,因?yàn)橐患?jí)氨基酸序列決定三維結(jié)構(gòu),結(jié)構(gòu)決定功能,若是在原有蛋白中插入一段序列,即使閱讀框不變,一級(jí)序列也變,原來蛋白性質(zhì)一定變化,這樣的突變多是致死的。老年人癌癥發(fā)病較高,多是基因缺失或變異,這樣的變異通常都是致死的。個(gè)人觀點(diǎn),僅供參考。 |
觀點(diǎn)相似,基因/蛋白的進(jìn)化(應(yīng)該是很大一部分)通過(普通的)突變和復(fù)制的方式進(jìn)行,在適應(yīng)環(huán)境的條件下"緩慢"進(jìn)化。應(yīng)為插入或缺失突變,整個(gè)基因變化較大,(應(yīng)該可能性很低),插入或缺失堿基為3的整數(shù)倍,同時(shí)還要處于對(duì)應(yīng)蛋白的loop區(qū)域(這樣對(duì)蛋白折疊一般影響不大),才有可能保留原有蛋白的功能或催化性能,這樣的概率可能是幾十萬分子一中的幾十萬分子一中的幾十萬分子一(假設(shè)每種情況的概率是幾十萬分子一)?戳四愕幕貜(fù),就更愿意相信插入或缺失突變比一般的突變更難,如果發(fā)生了這樣的突變,而蛋白能夠正確折疊,進(jìn)化中的新功能蛋白(很可能還是局限于這個(gè)蛋白家族功能之內(nèi))就出現(xiàn)了,這樣的進(jìn)化前后蛋白可能同源性很高,但是功能差異大。而不同于普通突變的累積,這樣的進(jìn)化前后的蛋白同源性可能低一點(diǎn),但功能差異不大。(于是這也可以成為進(jìn)化中的重要分水嶺,這當(dāng)然是自己想的。 )謝謝! |
| 點(diǎn)突變中轉(zhuǎn)換突變的頻率比顛換突變高。點(diǎn)突變又比插入和缺失高。插入和缺失,常見的是前面缺失一個(gè),隔幾個(gè)堿基有插入一個(gè),或者前面缺失1個(gè),隔一端又缺失2個(gè);或者類似的相插入后缺失。小段移碼突變可能有影響,但有些是不影響整個(gè)蛋白的基本功能的。其次才是缺失/插入3的倍數(shù)個(gè)堿基的。 |
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轉(zhuǎn)換的頻率高只要看下密碼子表的第三位就知道了,當(dāng)然,這是在不改變氨基酸種類的情況下的。至于發(fā)生氨基酸改變的種類的突變,缺失和移碼的,只是看論文和平時(shí)做多序列比對(duì)分析的留下的印象。我自己對(duì)統(tǒng)計(jì)不熟悉,沒有實(shí)際統(tǒng)計(jì)過,至于看過的統(tǒng)計(jì)分析以及基因突變的論文,我英語水平不高,英語方面的書籍看得少,僅推薦中文的,可以看羅遼復(fù)的研究論文和童克中的《基因及其表達(dá)》,盛祖佳的遺傳學(xué)方面的著作。 |
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