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[交流]
基因/蛋白進(jìn)化過程中的相關(guān)問題!
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| 在進(jìn)化過程中基因突變是普通的突變?nèi)菀走是插入或缺失突變?nèi)菀祝?我的理解是普通的突變更容易,插入或缺失突變只有移碼數(shù)為3的整數(shù)倍時(shí)才有可能保留原蛋白的特征,但很可能導(dǎo)致蛋白性能的重大變化,因此進(jìn)化中插入或缺失氨基酸是不是可能為蛋白進(jìn)化的較大分水嶺……希望和大家學(xué)習(xí)交流。。ㄖ饕俏矣龅搅丝赡艿倪M(jìn)化問題,歡迎大俠提供相關(guān)資料或鏈接,不勝感激。。 |
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轉(zhuǎn)換的頻率高只要看下密碼子表的第三位就知道了,當(dāng)然,這是在不改變氨基酸種類的情況下的。至于發(fā)生氨基酸改變的種類的突變,缺失和移碼的,只是看論文和平時(shí)做多序列比對(duì)分析的留下的印象。我自己對(duì)統(tǒng)計(jì)不熟悉,沒有實(shí)際統(tǒng)計(jì)過,至于看過的統(tǒng)計(jì)分析以及基因突變的論文,我英語(yǔ)水平不高,英語(yǔ)方面的書籍看得少,僅推薦中文的,可以看羅遼復(fù)的研究論文和童克中的《基因及其表達(dá)》,盛祖佳的遺傳學(xué)方面的著作。 |
| 單單從細(xì)胞增殖的過程看,我覺得點(diǎn)突變比插入或者缺失更容易(非病毒之類的感染)。但是基因修復(fù)能力還是很強(qiáng)的,突變率依然非常低。你說“插入或缺失突變只有移碼數(shù)為3的整數(shù)倍時(shí)才有可能保留原蛋白的特征,但很可能導(dǎo)致蛋白性能的重大變化,因此進(jìn)化中插入或缺失氨基酸是不是可能為蛋白進(jìn)化的較大分水嶺”。插入或缺失如果在外顯子內(nèi),可能不影響你最后蛋白的表達(dá),插入或缺失如果在你內(nèi)含子內(nèi),影響你蛋白正確的氨基酸編碼,那么這個(gè)突變必定是致死的(蛋白承擔(dān)重大生理功能,非可有可無或次級(jí)代謝產(chǎn)物的相關(guān)蛋白)。我覺得突變的過程是這樣的,生物體先點(diǎn)突變,這個(gè)突變不能太大影響生物體的正常生理功能,生物體能正常存活下來,然后通過重組遺傳等方式把這個(gè)突變保留下來。外界環(huán)境變化的時(shí)候,篩選有利基因,可能這個(gè)突變的基因能夠被富集。個(gè)人認(rèn)為插入原有蛋白中的片段大多是致死的,因?yàn)橐患?jí)氨基酸序列決定三維結(jié)構(gòu),結(jié)構(gòu)決定功能,若是在原有蛋白中插入一段序列,即使閱讀框不變,一級(jí)序列也變,原來蛋白性質(zhì)一定變化,這樣的突變多是致死的。老年人癌癥發(fā)病較高,多是基因缺失或變異,這樣的變異通常都是致死的。個(gè)人觀點(diǎn),僅供參考。 |
觀點(diǎn)相似,基因/蛋白的進(jìn)化(應(yīng)該是很大一部分)通過(普通的)突變和復(fù)制的方式進(jìn)行,在適應(yīng)環(huán)境的條件下"緩慢"進(jìn)化。應(yīng)為插入或缺失突變,整個(gè)基因變化較大,(應(yīng)該可能性很低),插入或缺失堿基為3的整數(shù)倍,同時(shí)還要處于對(duì)應(yīng)蛋白的loop區(qū)域(這樣對(duì)蛋白折疊一般影響不大),才有可能保留原有蛋白的功能或催化性能,這樣的概率可能是幾十萬(wàn)分子一中的幾十萬(wàn)分子一中的幾十萬(wàn)分子一(假設(shè)每種情況的概率是幾十萬(wàn)分子一)?戳四愕幕貜(fù),就更愿意相信插入或缺失突變比一般的突變更難,如果發(fā)生了這樣的突變,而蛋白能夠正確折疊,進(jìn)化中的新功能蛋白(很可能還是局限于這個(gè)蛋白家族功能之內(nèi))就出現(xiàn)了,這樣的進(jìn)化前后蛋白可能同源性很高,但是功能差異大。而不同于普通突變的累積,這樣的進(jìn)化前后的蛋白同源性可能低一點(diǎn),但功能差異不大。(于是這也可以成為進(jìn)化中的重要分水嶺,這當(dāng)然是自己想的。 )謝謝! |
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