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yangzuyou木蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
用MEGA5.10進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建,急
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Lys-3003菌16S rDNA測(cè)序結(jié)果 ACGGTCACTTCGGCGGCTGGCTCATAAAGGTTACCTCACCGACTTCGGGTGTTACAAACTCTCGTGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGCGGCATGCTGATCCGCGATTACTAGCGATTCCAGCTTCACGCAGTCGAGTTGCAGACTGCGATCCGAACTGAGAACAGATTTGTGGGATTGGCTTAACCTCGCGGTTTCGCTGCCCTTTGTTCTGTCCATTGTAGCACGTGTGTAGCCCAGGTCATAAGGGGCATGATGATTTGACGTCATCCCCACCTTCCTCcGGTTTGTCAcCGGCAGTCACCTTAGAGTGCCCaACTGAATGCTGGCAACTAAGATCAAGGGTTGCGCTCGTtGCGGGACTtAaCCCaACATCTCACGACACGAGCTGACGACAACCATGCACcACcTGTCACTCTGcCCCCGAAGGGGACGTCCTATCTCTAGGATTGTCAGAGGATGTCAAGACCTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAGTCTTGCGACCGTACTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAGCTGCAGCACTAAGGGGCGGAAACCCCCTAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGCTCCTCAGCGTCAGTTACAGACCAGAGAGTCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCACATCTCTACGCATTTCACCGCTACACGTGGAATTCCACTCTCCTCTTCTGCACTCAAGTTCCCCAGTTTCCAATGACCCTCCCCGGTTGAGCCGGGGGCTTTCACATCAGACTTAAGAAACCGCCTGCGAGCCCTTTACGCCCAATAATTCCGGACAaCGCTTGCCACCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGGTTAGGTACCGTCAAGGTGCCGCCCTATTTGAACGGCACTTGTTCTTCCCTAACAACAGAGCTTTACGATCCGAAAACCTTCATCACTCACGC-GGCGTTGCTCCGTCAGACTTTCGTCCATTGCGGAAGATTCCCTACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTGTGGCCGATCACCCTCTCAGGTCGGCTACGCATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCTCACCAACTAGCTAATGCGCCGCGGGTCCATCTGTAAGTGGTAGCCGAAGCCACCTTTTATGTCTGAACCATGCGGTTCAAACAACCATCCGGTATTAGCCCCGGTTTCCCGGAGTTATCCCAGTCTTACAGGCAGGTTACCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGGGAGCAAGCTCCCATCTGTCCGCTCGACTGCATTATAAAGCACCCCCCCCTG http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#444439690 上面是在ncbi比對(duì)的鏈接 怎樣才能給Lys-3003菌構(gòu)建一進(jìn)化樹(shù)?請(qǐng)各位大俠給新手以指導(dǎo)!謝謝! |
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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NCBI blast就有的 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/treeview/treeView.cgi,沒(méi)有尾巴那個(gè)就是你的序列 但是如果是要做的比較嚴(yán)密的話要看E值和coverage |
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
你可以根據(jù)我發(fā)的這個(gè)試一試,有問(wèn)題的話在交流…… |
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