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yangzuyou木蟲 (小有名氣)
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[求助]
用MEGA5.10進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建，急
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Lys-3003菌16S rDNA測(cè)序結(jié)果 ACGGTCACTTCGGCGGCTGGCTCATAAAGGTTACCTCACCGACTTCGGGTGTTACAAACTCTCGTGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGCGGCATGCTGATCCGCGATTACTAGCGATTCCAGCTTCACGCAGTCGAGTTGCAGACTGCGATCCGAACTGAGAACAGATTTGTGGGATTGGCTTAACCTCGCGGTTTCGCTGCCCTTTGTTCTGTCCATTGTAGCACGTGTGTAGCCCAGGTCATAAGGGGCATGATGATTTGACGTCATCCCCACCTTCCTCcGGTTTGTCAcCGGCAGTCACCTTAGAGTGCCCaACTGAATGCTGGCAACTAAGATCAAGGGTTGCGCTCGTtGCGGGACTtAaCCCaACATCTCACGACACGAGCTGACGACAACCATGCACcACcTGTCACTCTGcCCCCGAAGGGGACGTCCTATCTCTAGGATTGTCAGAGGATGTCAAGACCTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAGTCTTGCGACCGTACTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAGCTGCAGCACTAAGGGGCGGAAACCCCCTAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGCTCCTCAGCGTCAGTTACAGACCAGAGAGTCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCACATCTCTACGCATTTCACCGCTACACGTGGAATTCCACTCTCCTCTTCTGCACTCAAGTTCCCCAGTTTCCAATGACCCTCCCCGGTTGAGCCGGGGGCTTTCACATCAGACTTAAGAAACCGCCTGCGAGCCCTTTACGCCCAATAATTCCGGACAaCGCTTGCCACCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGGTTAGGTACCGTCAAGGTGCCGCCCTATTTGAACGGCACTTGTTCTTCCCTAACAACAGAGCTTTACGATCCGAAAACCTTCATCACTCACGC-GGCGTTGCTCCGTCAGACTTTCGTCCATTGCGGAAGATTCCCTACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTGTGGCCGATCACCCTCTCAGGTCGGCTACGCATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCTCACCAACTAGCTAATGCGCCGCGGGTCCATCTGTAAGTGGTAGCCGAAGCCACCTTTTATGTCTGAACCATGCGGTTCAAACAACCATCCGGTATTAGCCCCGGTTTCCCGGAGTTATCCCAGTCTTACAGGCAGGTTACCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGGGAGCAAGCTCCCATCTGTCCGCTCGACTGCATTATAAAGCACCCCCCCCTG http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#444439690 上面是在ncbi比對(duì)的鏈接 怎樣才能給Lys-3003菌構(gòu)建一進(jìn)化樹(shù)？請(qǐng)各位大俠給新手以指導(dǎo)！謝謝！ |
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weiyasong
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
yangzuyou: 金幣+5, ★有幫助, 謝謝 2013-06-18 22:45:57
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2013-06-08 16:22:04, 1.45 M
3樓2013-06-08 16:22:33
yitiandeng
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
yangzuyou: 金幣+5, ★有幫助, 謝謝 2013-06-18 22:45:39
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yangzuyou: 金幣+5, ★有幫助, 謝謝 2013-06-18 22:45:39
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NCBI blast就有的 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/treeview/treeView.cgi,沒(méi)有尾巴那個(gè)就是你的序列 但是如果是要做的比較嚴(yán)密的話要看E值和coverage |
2樓2013-06-08 08:46:57
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