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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 分子生物 » 綜合其他 » 基因表達問題
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zhousf0114銅蟲 (初入文壇)
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基因表達問題
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各位蟲友好： 我想問一下，我的基因終止密碼后面無意的又加入了一個終止密碼子，然后后面是完整的3‘UTR序列，這樣的話會對表達效率造成影響嗎？因為我選用的是自主型表達的啟動子。 |
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zhousf0114: 金幣+5, ★★★很有幫助 2013-06-26 15:28:22
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目前對于翻譯的終止密碼子的文獻好像不是很強調(diào)多個終止密碼子之間會有相互干擾，我沒有看到過此類材料，除非更靠近3’末端的終止密碼子會參與形成特定的二級結(jié)構(gòu)，并且這樣的二級結(jié)構(gòu)足以影響前一個終止密碼子的所在區(qū)域形成新的二級結(jié)構(gòu)，或者說形成Riboswitch，不過至少在原核細胞中Riboswitch多在5'-UTR，在植物細胞中倒是有在3'-UTR形成Riboswitch的。但是即使形成了Riboswitch，沒有小分子的效應物----SAM，TPP等，Riboswitch的構(gòu)象也不會發(fā)生改變而調(diào)節(jié)翻譯起始。Riboswitch對RNA的二級結(jié)構(gòu)的要求還是很高的，只加入一個終止密碼子不太可能形成新的Riboswitch。 至于會不會引起translational hopping 和 改變splicing ，著我就不知道了，但是translational hopping 和splicing 也是對于RNA的二級結(jié)構(gòu)有一定的要求，只加入一個終止密碼子不太可能形成新的translational hopping 和splicing 。 樓主可以做試驗試一下。 |
6樓2013-06-25 20:39:58
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目前對于翻譯的終止密碼子的文獻好像不是很強調(diào)多個終止密碼子之間會有相互干擾，一般就是第一個終止密碼子（最為靠近5’末端）能夠起到中止翻譯的作用。 但是實際上也許不是一定會如此。 如果第一個終止密碼子與3’-UTR的間距與一般情況下的平均間距不是差得較多的話。但是如果更加最為靠近5’末端的那個終止密碼子對于3’-UTR的有關莖環(huán)結(jié)構(gòu)離得很遠（超過2個以上的核糖體的最大寬度），而更靠近3’末端的那個終止密碼子對于3’-UTR的有關莖環(huán)結(jié)構(gòu)離得比較適當（大致在1個核糖體的最大寬度之內(nèi)），那么核糖體到底選擇哪個終止密碼子可能就有一定的概率問題，既可能會選擇更靠近3’末端的那個終止密碼子的密碼子，怎可能不是一個熱力學問題，而是動力學問題。 |
7樓2013-06-25 20:50:47
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