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新蟲 (初入文壇)

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[求助] 酵母基因敲除同源臂一直P不出來

我在KEGG上查的基因序列，要敲除掉，大概1500bp左右，我在左邊的700bp范圍內(nèi)P左臂，在右邊700bp范圍內(nèi)P右臂，右臂一次就P對(duì)了，左臂P了好多次了，長(zhǎng)度一直不對(duì)，應(yīng)該是600左右，P出來總是1200左右。我想知道KEGG上關(guān)于酵母的基因序列帶有內(nèi)含子么，是內(nèi)含子搞的鬼么。

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1樓 2013-07-01 09:08:12

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貓di閣樓

銅蟲 (初入文壇)

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【答案】應(yīng)助回帖

應(yīng)該不是內(nèi)含子的問題
你用BLAST查一下是不是你的引物和其他位置互補(bǔ)
可能是和其他部分產(chǎn)生互補(bǔ)后擴(kuò)增除了非特異片段
我也是做酵母敲除
有什么經(jīng)驗(yàn)可以多聯(lián)系~
祝好運(yùn)

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回復(fù)此樓

2樓2013-11-12 19:21:44

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