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[求助]
關(guān)于蛋白酶特異性斷裂氨基酸序列的問題
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之前查閱資料發(fā)現(xiàn)好多蛋白酶可以特異的切斷某種特定的氨基酸序列，比如一種蛋白酶A可以特異的水解XX的氨基酸序列。 那么排除臨位氨基酸和空間結(jié)構(gòu)等因素，是不是我只要設(shè)計(jì)一個(gè)含有此序列的多肽，在條件合適的情況下蛋白酶就會(huì)只在這一點(diǎn)作用而不會(huì)影響其他的氨基酸序列。比如我有一個(gè)肽鏈YYYYYXXYYY，他是不是可以單一的斷裂成YYYYYX和XYYY兩種特定的序列呢？ 一般來說只要不是太過分設(shè)計(jì)的肽鏈都可以按照特定需求催化斷裂嗎？求做蛋白酶相關(guān)實(shí)驗(yàn)的大神們解答。另外希望大神推薦幾種較為中性的比較常用的特異性蛋白酶。 |
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wizardfan
至尊木蟲 (著名寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
supdragon: 金幣+4, 恩，這個(gè)我也在文獻(xiàn)中看過，是由于位阻的原因，還有一個(gè)阻礙催化的原因是電荷 2013-10-16 10:50:49
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supdragon: 金幣+4, 恩，這個(gè)我也在文獻(xiàn)中看過，是由于位阻的原因，還有一個(gè)阻礙催化的原因是電荷 2013-10-16 10:50:49
| 不完全是。在蛋白組學(xué)里有個(gè)missed cleavage的概念。比如最常用的trypsin，特異位點(diǎn)是不在P前面的KR。那理論上序列VADKMDAVRPRY可以分解成3部分，VADK,MDAVRPR,Y，但是如果走質(zhì)譜的話，也有可能觀察到MDAVRPRY，這個(gè)就有1個(gè)miss cleavage。 |
5樓2013-10-16 06:01:53
落葉vs秋水 
新蟲 (初入文壇)
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2樓2013-10-15 09:14:29
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