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跑完Gromacs的動力學(xué)模擬之后的軌跡文件.trr里面沒有內(nèi)容，為什么？
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RT,小弟用GMX跑ligand和蛋白的體系1ns，在各種優(yōu)化平衡之后，輸入 grompp -f md.mdp -c npt.gro -t npt.cpt -p topol.top -n index.ndx -o md_0_1.tpr mdrun -deffnm md_0_1 命令行運(yùn)行數(shù)小時后，出來的md_0_1.trr文件大小為0，沒有載入任何數(shù)據(jù)，為什么呢？之前平衡壓力和溫度的.trr文件里倒是寫入了數(shù)據(jù)也觀察到了模擬。 盼高手解答，謝謝！ |
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pkuchemistry
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