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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » MS » gromacs跑動力學時，水分子的影響
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gromacs跑動力學時，水分子的影響
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| 用gromacs跑動力學，溶質是帶一個正電荷的季銨鹽，加入反離子如F-, Cl-, Br-, 平衡后陰離子吸附在溶質分子上；當加入溶劑水以后，陰離子就擴散到水相中了，而不能吸附到溶質分子上�？戳艘幌码姾煞植迹琓IP3P水分子（O -8.34, H 4.17, H 4.17），溶質分子上的電荷的數值相對水的�。ù蠖际� -0.2, 0.2, -0.1, 0.1這樣的較小的數值）。這可能是導致陰離子被帶有較大靜電荷的水拉到水相中的原因。而我想做的恰恰是陰離子對溶質構型的影響，所以這個問題是我很傷腦筋，不知道該如何處理？曾想過改變水的電荷值，但據說水分子模型的電荷不能隨便改，改了就不是水了。請問各位大俠遇到這類問題該如何處理？謝謝！ |
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2樓2012-06-20 16:56:47
3樓2012-06-20 19:37:33
 喔~ |
4樓2012-06-21 08:38:49
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