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AIfever木蟲 (正式寫手)
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[求助]
關(guān)于引物設(shè)計(jì)的問題 已有1人參與
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請(qǐng)問為什么針對(duì)同一種細(xì)胞的同一段基因,不同文獻(xiàn)上查到的引物序列差別很大呢?自己又不太會(huì)設(shè)計(jì)引物,求大神指點(diǎn)啊![]() [ Last edited by AIfever on 2013-12-18 at 17:00 ] |
木蟲 (正式寫手)
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一般引物就是由三部分組成: 保護(hù)堿基+酶切位點(diǎn)+互補(bǔ)序列。 1、酶切位點(diǎn)是根據(jù)自己需要設(shè)計(jì)的,所以你要看看不同文獻(xiàn)用的酶切位點(diǎn)序列是不是不一樣。同樣,對(duì)應(yīng)的保護(hù)堿基也會(huì)不一樣。 2、互補(bǔ)序列是針對(duì)基因序列設(shè)計(jì)的,長(zhǎng)度一般15-25bp左右,只要是同一段基因,互補(bǔ)序列應(yīng)該大體是一樣的,只是長(zhǎng)度有所不同。設(shè)計(jì)引物的時(shí)候,會(huì)根據(jù)引物和模板的錯(cuò)配情況調(diào)整互補(bǔ)序列的長(zhǎng)度。所以,不同文獻(xiàn),互補(bǔ)序列的長(zhǎng)度也可能會(huì)不一樣。 |
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