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vallen銀蟲 (正式寫手)
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[求助]
關(guān)于兩個分子間電子轉(zhuǎn)移的計(jì)算 已有2人參與
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假設(shè)有兩個分子1和2,看分子1是不是會比較容易轉(zhuǎn)移電子給分子2,我想通過下面的方法來考察, 1.做差分電荷密度圖,看是不是有電荷轉(zhuǎn)移,并計(jì)算電荷轉(zhuǎn)移數(shù) 2. 計(jì)算分子1的HOMO和分子2的LUMO是不是會有重疊,是不是能級比較接近,這樣便于電子從1的HOMO轉(zhuǎn)移到2的LUMO 不知道對不對?請高人解答 |
計(jì)算化學(xué) |
版主 (著名寫手)
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大體上應(yīng)是這樣的。 只是在順序上可以先計(jì)算分子1的HOMO和分子2的LUMO,看它們在什么方位上軌道對稱性在重疊時是符合的,能級比較接近。 接著按這種對稱性符合的方位組建相互作用的構(gòu)型,優(yōu)化,再做差分電荷密度圖,看是不是有電荷轉(zhuǎn)移,并計(jì)算電荷轉(zhuǎn)移數(shù)。差分電荷密度復(fù)雜時,要在multiwfn中做盆分析才能確定。 |
木蟲 (正式寫手)
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臺灣中研院的許昭萍在這個問題上做了大量的工作。比如: http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ja045087t 還有一種辦法叫constrained DFT (CDFT)也可以很好的解決這個問題。 http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1 ... &volume=110 (J. Phys. Chem. A. 110, 9212) |
木蟲 (正式寫手)
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對了,最近TCNQ這個體系比較熱,有不少理論計(jì)算的工作都是這個分子的復(fù)合物的: THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 129, 064707 (2008) http://arxiv.org/abs/1207.3726 http://www.chem.uit.no/nks/info/MK_Abstract.pdf |
銀蟲 (正式寫手)
版主 (著名寫手)
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涉及到分子間作用,沒有普適的方法,要具體分子具體分析。 涉及的是兩個分子間作用并有電子在二者之間轉(zhuǎn)移,如果不涉及激發(fā)態(tài)的話,可能會有多種情形:1向2提供孤對電子生成配位鍵;1向2提供孤對電子生成氫鍵;1和2產(chǎn)生范德華作用。 看軌道對稱性來設(shè)置分子擺放的位置,也就是根據(jù)上面各種情況來看分子1的HOMO和分子2的LUMO。然后再來組合。這個初步判斷,可以省去大量優(yōu)化時的計(jì)算量。進(jìn)一步的優(yōu)化才決定結(jié)構(gòu)。 比如,氫鍵,分子1的HOMO是孤對電子,它是一個p型電子。分子2的LUMO也要構(gòu)成一個p型電子的形象,以達(dá)到對稱性相符。 孤對電子與它所在的分子中其它電子在對稱性上是正交的,所形成的HOMO常是單純獨(dú)立的。即使是在復(fù)雜的HOMO中,也可以明顯地看到孤對電子局部,看到它的相位。 范德華作用也會在二者之間有電荷轉(zhuǎn)移的,這從電子密度差可以核算出來(通過multiwfn作盆積分)。 [ Last edited by zhou2009 on 2014-1-23 at 16:38 ] |
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