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牧煬

金蟲 (小有名氣)

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專業(yè): 生物化學(xué)

[求助] pymol中關(guān)于align的問題

=。=小白因?yàn)樽罱厴I(yè)論文做的是生物信息學(xué)部分的要做血紅蛋白Hb和髓過氧化物酶MPO三級(jí)結(jié)構(gòu)的對(duì)比

現(xiàn)在蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)已經(jīng)模擬成功  生成pdb文件  在pymol中打開后  對(duì)兩個(gè)蛋白質(zhì)模型進(jìn)行align

得到如下圖的情形(為4和6的對(duì)比及1和4的對(duì)比) 但是不知道處理怎么才能只顯示重疊部分  弱化非重疊部分

比如相關(guān)命令怎么編輯等等  - -我看過很多指導(dǎo)的帖子但是好像不是很懂  所以希望能講的詳細(xì)一些

求各位大神指教  或者有更好的結(jié)構(gòu)對(duì)比方法提供  謝謝

4-6align.jpg

1-4align.png

[ Last edited by 牧煬 on 2014-2-17 at 12:13 ]

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1樓 2014-02-17 12:06:31

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