 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 4303 | 回復(fù): 15 | ||
[求助]
pymol 小分子的疊合
|
||
|
請(qǐng)教大家，我對(duì)接了2個(gè)化合物進(jìn)入2個(gè)PDB文件（靶點(diǎn)是一樣的，也就是說同一靶點(diǎn)的2類小分子，當(dāng)然PDB不同），想用pymol進(jìn)行疊合（4個(gè)文件，即site和ligand各一對(duì)），2個(gè)site可以通過A--align--to molecule ……來實(shí)現(xiàn)，但是小分子ligand 通過此方法不行，請(qǐng)教如何讓也實(shí)現(xiàn)小分子的疊合（site疊合site，ligand疊合ligand）,謝謝！ 不知道我有沒有說明白，謝謝！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
26考研求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
求調(diào)劑，總分315，考的生物醫(yī)藥，一志愿湖南師范大學(xué)。調(diào)劑到任何專業(yè)都可以
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
085600材料與化工求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
311求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
303求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
有沒有道鐵/土木的想調(diào)劑南林，給自己招師弟中～
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
梁成偉老師課題組歡迎你的加入
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
一志愿蘇州大學(xué)材料工程（085601）專碩有科研經(jīng)歷三項(xiàng)國獎(jiǎng)兩個(gè)實(shí)用型專利一項(xiàng)省級(jí)立項(xiàng)
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
070300化學(xué)319求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿天津大學(xué)化學(xué)工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 請(qǐng)幫我用pymol做一個(gè)很簡(jiǎn)單的分子疊合吧，菜鳥我做了很久都疊不上
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 請(qǐng)教如何將下載下來的蛋白中的小分子配體刪掉？
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 關(guān)于用Pymol做分子疊合
已經(jīng)有6人回復(fù)
- sybyl對(duì)接結(jié)果如何與晶體結(jié)果疊合？
已經(jīng)有11人回復(fù)
- Pymol分析對(duì)接后的pdb文件
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 這個(gè)蛋白結(jié)構(gòu)圖用什么軟件可以做出來
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 求助高手怎么用pymol做這兩個(gè)圖
已經(jīng)有6人回復(fù)
- ＰＹＭＯＬ軟件安裝不了
已經(jīng)有6人回復(fù)
- PYMOL與VMD作圖的區(qū)別
已經(jīng)有11人回復(fù)
- DS 做分子對(duì)接
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 請(qǐng)教高人，我的pymol軟件導(dǎo)入蛋白后進(jìn)行cartoon時(shí)，出現(xiàn)的怎么是loop結(jié)構(gòu)？
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 使用Pymol進(jìn)行蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)的比較
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 求教：關(guān)于Pymol打開蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)文件的問題
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 請(qǐng)高手指導(dǎo)，我的pymol為何不顯示氫鍵
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 用pymol顯示氫鍵的問題，在線等，急需解決，謝謝！
已經(jīng)有4人回復(fù)
- Pymol中批量疊合腳本
已經(jīng)有3人回復(fù)
- pymol作圖，謝謝
已經(jīng)有6人回復(fù)
4樓2013-10-10 10:11:00
2樓2013-10-09 18:26:01
alarace
至尊木蟲 (知名作家)
- 應(yīng)助: 82 (初中生)
- 金幣: 20020.9
- 散金: 15172
- 紅花: 20
- 帖子: 9154
- 在線: 2796.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 1546961
- 注冊(cè): 2011-12-22
- 專業(yè): 微生物生理與生物化學(xué)
3樓2013-10-09 20:47:33
once1015
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 17 (小學(xué)生)
- 金幣: 4613.8
- 散金: 805
- 紅花: 3
- 帖子: 604
- 在線: 618小時(shí)
- 蟲號(hào): 1903462
- 注冊(cè): 2012-07-21
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
5樓2013-10-10 11:46:17
alarace
至尊木蟲 (知名作家)
- 應(yīng)助: 82 (初中生)
- 金幣: 20020.9
- 散金: 15172
- 紅花: 20
- 帖子: 9154
- 在線: 2796.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 1546961
- 注冊(cè): 2011-12-22
- 專業(yè): 微生物生理與生物化學(xué)
6樓2013-10-10 12:11:22
fengxinzi78
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 1328.7
- 紅花: 20
- 帖子: 341
- 在線: 105.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 2307214
- 注冊(cè): 2013-02-28
- 性別: MM
- 專業(yè): 光譜分析
7樓2013-10-10 14:47:21
bao65662
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 3
- 帖子: 1
- 在線: 14分鐘
- 蟲號(hào): 2991224
- 注冊(cè): 2014-02-24
- 專業(yè): 呼吸系統(tǒng)炎癥與感染
8樓2014-04-30 11:02:37
9樓2014-05-07 15:57:49
sunshine???
新蟲 (職業(yè)作家)
- 應(yīng)助: 17 (小學(xué)生)
- 金幣: 12032
- 散金: 1241
- 紅花: 13
- 帖子: 3311
- 在線: 177小時(shí)
- 蟲號(hào): 4566282
- 注冊(cè): 2016-04-03
- 性別: GG
- 專業(yè): 藥物化學(xué)
|
我也遇到這種問題了，一個(gè)蛋白晶體結(jié)構(gòu)沒有配體，一個(gè)晶體結(jié)構(gòu)有配體，讓這兩個(gè)晶體結(jié)構(gòu)疊合比較容易。但是，我自己設(shè)計(jì)了一個(gè)小分子，想要和已經(jīng)有晶體結(jié)構(gòu)中的小分子進(jìn)行疊合該怎么處理呢？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
10樓2019-11-30 10:22:14
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 啄木鳥NO.1 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料工程專碩274一志愿211求調(diào)劑 +6 | 薛云鵬 2026-03-15 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[碩博家園] 深圳大學(xué)碩士招生（2026秋，傳感器方向，僅錄取第一志愿） +4 | xujiaoszu 2026-03-11 | 9/450 |
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +7 | 小熊joy 2026-03-14 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 301求調(diào)劑 +3 | A_JiXing 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 283求調(diào)劑 +3 | 聽風(fēng)就是雨； 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 318求調(diào)劑 +3 | Yanyali 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 26考研一志愿中國石油大學(xué)(華東)305分求調(diào)劑 +3 | 嘉年新程 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0856專碩279求調(diào)劑 +5 | 加油加油！? 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料工程327求調(diào)劑 +3 | xiaohe12w 2026-03-11 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿哈工大材料324分求調(diào)劑 +5 | 閆旭東 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 331求調(diào)劑（0703有機(jī)化學(xué) +5 | ZY-05 2026-03-13 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 求材料調(diào)劑 085600英一數(shù)二總分302 前三科235 精通機(jī)器學(xué)習(xí) 一志愿哈工大 +4 | 林yaxin 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0856材料與化工301求調(diào)劑 +5 | 奕束光 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +3 | miaodesi 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 314求調(diào)劑 +7 | 無懈可擊的巨人 2026-03-12 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 274求調(diào)劑 +3 | S.H1 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料301分求調(diào)劑 +5 | Liyouyumairs 2026-03-12 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0817化學(xué)工程與技術(shù)考研312分調(diào)劑 +3 | T123 tt 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 081200-11408-276學(xué)碩求調(diào)劑 +3 | 崔wj 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考博] 2026年博士申請(qǐng) +3 | QwQwQW10 2026-03-11 | 3/150 |
|