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pymol 小分子的疊合
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請教大家，我對接了2個化合物進入2個PDB文件（靶點是一樣的，也就是說同一靶點的2類小分子，當然PDB不同），想用pymol進行疊合（4個文件，即site和ligand各一對），2個site可以通過A--align--to molecule ……來實現(xiàn)，但是小分子ligand 通過此方法不行，請教如何讓也實現(xiàn)小分子的疊合（site疊合site，ligand疊合ligand）,謝謝！ 不知道我有沒有說明白，謝謝！ |
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alarace
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我也遇到這種問題了，一個蛋白晶體結構沒有配體，一個晶體結構有配體，讓這兩個晶體結構疊合比較容易。但是，我自己設計了一個小分子，想要和已經有晶體結構中的小分子進行疊合該怎么處理呢？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
10樓2019-11-30 10:22:14
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