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桃子三三

銀蟲(chóng) (小有名氣)

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[求助] 散重金求助，perl語(yǔ)言問(wèn)題已有1人參與

兩個(gè)文本求合集的程序
文件1.txt,內(nèi)容如下
>Os01g0100100 1213
>Os01g0100200 1257
>Os01g0100500 524 701 1293 1384 1427
>Os01g0100600 799 961 1068 1795
>Os01g0100700 379 498
>Os01g0100800 1409 1670
>Os01g0100900 166 432 1054
>Os01g0101200 0
>Os01g0101600 209 258 371 1115 1494 1528
>Os01g0101700 60 399 429 462 828 889
文件2.txt，內(nèi)容如下
>Os01g0100100 0
>Os01g0100200 0
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>Os01g0100700 0
>Os01g0100800 0
>Os01g0100900 0
>Os01g0101200 123
>Os01g0101600 0
>Os01g0101700 0
想看合集后的情況，并生成一個(gè)文本。
重金求謝�。。。�

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1樓 2014-02-18 18:09:42

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forrestgump

新蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

perl語(yǔ)言是生物信息學(xué)領(lǐng)域的實(shí)用編程語(yǔ)言，建議到生物信息版塊找高手看，我是不懂這個(gè)玩意。

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5樓2014-02-19 19:26:34

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XOooZzz

銀蟲(chóng) (小有名氣)

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不懂perl，且也沒(méi)看懂你說(shuō)的求合集是什么意思。

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2樓2014-02-18 20:29:19

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桃子三三

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引用回帖:

2樓: Originally posted by XOooZzz at 2014-02-18 20:29:19
不懂perl，且也沒(méi)看懂你說(shuō)的求合集是什么意思。

就是比如〉Os01g0101700  0（文本1）
         〉Os01g0101700  12（文本2）
生產(chǎn)（文本3）〉Os01g0101700  12

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3樓2014-02-18 20:35:41

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XOooZzz

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桃子三三(kx444555代發(fā)): 金幣+10, 鼓勵(lì)交流 2014-02-20 08:29:11

perl沒(méi)學(xué)過(guò)，不懂語(yǔ)法。不過(guò)除非perl有現(xiàn)成的實(shí)現(xiàn)你的功能的函數(shù)，否則算法應(yīng)該和其它語(yǔ)言的差不多。主程序框架大概是這樣吧：

1、讀取文件1的一行數(shù)據(jù);
2、提取該行數(shù)據(jù)的基因號(hào);
3、找到文件2中含該基因號(hào)的行并記下該行行號(hào);
4、合并這行的數(shù)值;
5、將生成的新行寫(xiě)入新文件;
返回步驟1處理下一行的數(shù)據(jù)，直到已經(jīng)把文件1處理完;
6、如果文件2有些行沒(méi)與文件1對(duì)上，把這些行也復(fù)制到新文件中;

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4樓2014-02-19 11:07:52

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普通表情龍兔虎貓

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