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diligence89木蟲 (小有名氣)
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[求助]
請問溶劑極性對分子激發(fā)態(tài)穩(wěn)定性的影響怎么計算 已有1人參與
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| 如題,我有一個分子,分子內(nèi)有一個羥基,羥基左邊有一個N原子,右邊有一個O原子,羥基與N原子形成氫鍵的話,就是一個六元環(huán);羥基與O原子形成氫鍵的話,會形成一個五元環(huán);我想知道在激發(fā)態(tài)羥基是更容易和N、O之間的那個原子形成氫鍵,以及溶劑極性對氫鍵的影響。 |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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樓主是想考察分子處于激發(fā)態(tài)時是如何形成分子內(nèi)氫鍵的,和溶劑效應(yīng)對這個氫鍵的影響? 激發(fā)態(tài)的工作沒有做過,只做過基態(tài)的,只能說個大概的思路。 思路:分子處于激發(fā)態(tài)時,進行幾何優(yōu)化,對優(yōu)化完畢的構(gòu)型進行分析,看看是N還是O與羥基的H形成氫鍵,可以從距離直觀判斷,從能量大小來判斷哪個更容易。對優(yōu)化構(gòu)型加上個溶劑模型,可以選擇PCM,CPCM模型等,哪個模型合適要進行嘗試,或者依據(jù)文獻,或者跟實驗值比較來確定。優(yōu)化完畢后,同上分析。 最后結(jié)合NBO和AIM理論來對構(gòu)型進行分析,說明是某某跟H形成氫鍵。 操作:在高斯軟件中如何進行激發(fā)態(tài)計算,幾何優(yōu)化等操作,自己要去看高斯手冊,遇到問題找小木蟲。 既然有氫鍵,要考慮到弱相互作用,B3LYP顯然不太合適。選擇合適的方法和基組來計算,這個要自己嘗試,或者依據(jù)文獻。 |
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