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diligence89木蟲 (小有名氣)
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[求助]
請(qǐng)問溶劑極性對(duì)分子激發(fā)態(tài)穩(wěn)定性的影響怎么計(jì)算 已有1人參與
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| 如題，我有一個(gè)分子，分子內(nèi)有一個(gè)羥基，羥基左邊有一個(gè)N原子，右邊有一個(gè)O原子，羥基與N原子形成氫鍵的話，就是一個(gè)六元環(huán)；羥基與O原子形成氫鍵的話，會(huì)形成一個(gè)五元環(huán)；我想知道在激發(fā)態(tài)羥基是更容易和N、O之間的那個(gè)原子形成氫鍵，以及溶劑極性對(duì)氫鍵的影響。 |
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cg陳
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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2樓2014-03-14 14:18:51
cg陳
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樓主是想考察分子處于激發(fā)態(tài)時(shí)是如何形成分子內(nèi)氫鍵的，和溶劑效應(yīng)對(duì)這個(gè)氫鍵的影響？ 激發(fā)態(tài)的工作沒有做過，只做過基態(tài)的，只能說個(gè)大概的思路。 思路：分子處于激發(fā)態(tài)時(shí)，進(jìn)行幾何優(yōu)化，對(duì)優(yōu)化完畢的構(gòu)型進(jìn)行分析，看看是N還是O與羥基的H形成氫鍵，可以從距離直觀判斷，從能量大小來判斷哪個(gè)更容易。對(duì)優(yōu)化構(gòu)型加上個(gè)溶劑模型，可以選擇PCM，CPCM模型等，哪個(gè)模型合適要進(jìn)行嘗試，或者依據(jù)文獻(xiàn)，或者跟實(shí)驗(yàn)值比較來確定。優(yōu)化完畢后，同上分析。 最后結(jié)合NBO和AIM理論來對(duì)構(gòu)型進(jìn)行分析，說明是某某跟H形成氫鍵。 操作：在高斯軟件中如何進(jìn)行激發(fā)態(tài)計(jì)算，幾何優(yōu)化等操作，自己要去看高斯手冊(cè)，遇到問題找小木蟲。 既然有氫鍵，要考慮到弱相互作用，B3LYP顯然不太合適。選擇合適的方法和基組來計(jì)算，這個(gè)要自己嘗試，或者依據(jù)文獻(xiàn)。 |
3樓2014-03-14 21:31:33
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