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夏天的普洱茶木蟲 (著名寫手)
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[求助]
擴全長選walking還是RACE? 已有2人參與
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| 最近根據(jù)N端保守區(qū)和中間一個保守區(qū)域擴增出一個大約700bp的片段,比對后發(fā)現(xiàn)是我要的酶,現(xiàn)在想擴增全長,查了些資料后,不知道該選哪個方法,請蟲友們給個建議。我的菌是細菌,現(xiàn)在知道5‘端的700個堿基,具體全序列有多長還不知道,查了些資料說可以用genome walking或者race,這兩種選哪一個比較好呢? |
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專家經(jīng)驗: +24 |
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由于你是原核的,所以獲得cDNA的全長序列和基因所在的全長基因組序列是一樣的 你這個問題的本質(zhì)就是你需要擴增你已知的700bp序列的側(cè)翼序列,即所謂的genome walking 由已知序列擴未知序列,方法有很多 常用的有iPCR,adaptor-PCR,Tail-PCR,個人經(jīng)驗iPCR配合nested PCR成功率比較高 |

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木蟲 (著名寫手)
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