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幸雪冰新蟲 (初入文壇)
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[求助]
CASTEP優(yōu)化問題 已有3人參與
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各位大神,本人更接觸MS,不太懂,求幫助 我用CASTEP優(yōu)化一個(gè)有機(jī)大分子,大概70個(gè)原子,臺(tái)式機(jī)計(jì)算,不是工作站 一天了,一直顯示的是running,但是進(jìn)程沒有數(shù)據(jù),是沒插網(wǎng)線的原因嗎?還是計(jì)算很慢 |
至尊木蟲 (正式寫手)
| 沒有關(guān)系,應(yīng)該是體系太大,但是你的電腦配置太低,計(jì)算的太慢了,一天沒有計(jì)算出一個(gè)點(diǎn),你可以查看一下遠(yuǎn)程服務(wù)器上的計(jì)算文件,看一下計(jì)算了多少了。直接在任務(wù)欄中選擇正在計(jì)算的任務(wù),然后右鍵點(diǎn)擊,選擇遠(yuǎn)程查看,就可以了。如果你計(jì)算的時(shí)候只選擇了一個(gè)核的話,插不插網(wǎng)線都沒有關(guān)系,如果多于一個(gè)核,不插網(wǎng)線,無法提交任務(wù),所以這一點(diǎn)不用擔(dān)心。 |
專家顧問 (著名寫手)
Ab Initio Amateur
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專家經(jīng)驗(yàn): +224 |

專家顧問 (著名寫手)
Ab Initio Amateur
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專家經(jīng)驗(yàn): +224 |
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我指的是,castep計(jì)算孤立的分子必須采用很大的盒子才能保證分子是孤立的,否則模型不合理很有可能導(dǎo)致scf不收斂,即便得到結(jié)果也是沒啥意義的。 你的意思可能有點(diǎn)模糊,我不太了解你是計(jì)算成功了還是還在那邊算,如果計(jì)算成功,但是沒出現(xiàn)收斂過程的曲線,你可以在analysis-energy evolution-import得到這個(gè)圖。如果你的進(jìn)程還在計(jì)算,有兩種情況: 對(duì)于windows,只能通過MS中的進(jìn)程欄右鍵你的進(jìn)程-remote view,此時(shí)IE顯示了你的gateway中的內(nèi)容,打開*.castep文件,里面記錄了當(dāng)前計(jì)算中每一步的convergence,你可以看看是不是因?yàn)闆]收斂。 對(duì)于linux也可采用類似的方法,更快捷的就是cd 在MS的目錄下的/etc/Gateway/dsd/jobs/你任務(wù)的編號(hào)/,然后tail -f *.castep,來觀測你的convergence |

新蟲 (初入文壇)
至尊木蟲 (正式寫手)
新蟲 (初入文壇)
至尊木蟲 (著名寫手)

新蟲 (初入文壇)
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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你要看你的計(jì)算到底如何了,之需要在瀏覽器中輸入你的服務(wù)器IP地址加網(wǎng)關(guān),比如:http://49.123.104.5:18888/ 網(wǎng)頁下面就會(huì)顯示你現(xiàn)在計(jì)算的所有數(shù)據(jù),點(diǎn)擊*.castep,查看現(xiàn)在計(jì)算到哪里了。 你計(jì)算一直沒有出現(xiàn)數(shù)據(jù),是你的第一步自洽一直再算,所以一直都不會(huì)有能量收斂值顯示出來。但是你可以按照我說的看看你的能量是否收斂,并可以監(jiān)控計(jì)算過程。 |
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