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幸雪冰新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
CASTEP優(yōu)化問(wèn)題 已有3人參與
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各位大神，本人更接觸MS，不太懂，求幫助 我用CASTEP優(yōu)化一個(gè)有機(jī)大分子，大概70個(gè)原子，臺(tái)式機(jī)計(jì)算，不是工作站 一天了，一直顯示的是running，但是進(jìn)程沒(méi)有數(shù)據(jù)，是沒(méi)插網(wǎng)線的原因嗎？還是計(jì)算很慢 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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franch: 金幣+2, 謝謝回帖交流。。。 2014-04-14 21:38:08
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| 沒(méi)有關(guān)系，應(yīng)該是體系太大，但是你的電腦配置太低，計(jì)算的太慢了，一天沒(méi)有計(jì)算出一個(gè)點(diǎn)，你可以查看一下遠(yuǎn)程服務(wù)器上的計(jì)算文件，看一下計(jì)算了多少了。直接在任務(wù)欄中選擇正在計(jì)算的任務(wù)，然后右鍵點(diǎn)擊，選擇遠(yuǎn)程查看，就可以了。如果你計(jì)算的時(shí)候只選擇了一個(gè)核的話，插不插網(wǎng)線都沒(méi)有關(guān)系，如果多于一個(gè)核，不插網(wǎng)線，無(wú)法提交任務(wù)，所以這一點(diǎn)不用擔(dān)心。 |
2樓2014-03-27 09:22:33
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5樓2014-04-03 09:16:28
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franch: 金幣+2, 謝謝回帖交流。。。 2014-04-14 21:38:30
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我指的是，castep計(jì)算孤立的分子必須采用很大的盒子才能保證分子是孤立的，否則模型不合理很有可能導(dǎo)致scf不收斂，即便得到結(jié)果也是沒(méi)啥意義的。 你的意思可能有點(diǎn)模糊，我不太了解你是計(jì)算成功了還是還在那邊算，如果計(jì)算成功，但是沒(méi)出現(xiàn)收斂過(guò)程的曲線，你可以在analysis-energy evolution-import得到這個(gè)圖。如果你的進(jìn)程還在計(jì)算，有兩種情況： 對(duì)于windows，只能通過(guò)MS中的進(jìn)程欄右鍵你的進(jìn)程-remote view，此時(shí)IE顯示了你的gateway中的內(nèi)容，打開(kāi)*.castep文件，里面記錄了當(dāng)前計(jì)算中每一步的convergence，你可以看看是不是因?yàn)闆](méi)收斂。 對(duì)于linux也可采用類似的方法，更快捷的就是cd 在MS的目錄下的/etc/Gateway/dsd/jobs/你任務(wù)的編號(hào)/，然后tail -f *.castep，來(lái)觀測(cè)你的convergence |
7樓2014-04-04 19:33:54
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3樓2014-04-02 09:26:55
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6樓2014-04-04 18:39:42
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8樓2014-04-05 08:17:06
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9樓2014-04-14 20:36:09
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【答案】應(yīng)助回帖
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你要看你的計(jì)算到底如何了，之需要在瀏覽器中輸入你的服務(wù)器IP地址加網(wǎng)關(guān)，比如：http://49.123.104.5:18888/ 網(wǎng)頁(yè)下面就會(huì)顯示你現(xiàn)在計(jì)算的所有數(shù)據(jù)，點(diǎn)擊*.castep,查看現(xiàn)在計(jì)算到哪里了。 你計(jì)算一直沒(méi)有出現(xiàn)數(shù)據(jù)，是你的第一步自洽一直再算，所以一直都不會(huì)有能量收斂值顯示出來(lái)。但是你可以按照我說(shuō)的看看你的能量是否收斂，并可以監(jiān)控計(jì)算過(guò)程。 |
10樓2014-04-14 22:33:02
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