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mf書蟲銀蟲 (初入文壇)
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[求助]
急求PCR相關(guān)知識
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求助PCR注意要點,尤其是退火溫度和時間對PCR的影響,延伸時間和片段長短的關(guān)系。 我做的全基因檢測,有一個基因別人退火時間30s就能跑出來,我的要1分30s才能有,大約一千bp,我想知道退貨時間這么長會不會有什么影響 |
木蟲 (著名寫手)
一條大魚

銀蟲 (初入文壇)
至尊木蟲 (知名作家)
逆水行舟,不進則退
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其實PCR的退火溫度和時間是根據(jù)你的引物和目的片段大小而定的。 時間短一些可以得到更好的效果. 因為, polymerase 在 AT(退火溫度).時也會有一些活性. 所以在A.T.的時間過長, 會極大的增加非特異性擴增的風(fēng)險。 退火溫度和片段長度相關(guān),片段長退火時間長一些,一般2min也可以的 預(yù)變性和變性的時間是由模板的長度和GC含量來確定的,當(dāng)然這個時間并不像退火溫度那樣有個可以參考的計算公式,一般來講預(yù)變性95℃,5min完全可以解開模板的雙鏈,如果模板分子量比較大(比如是從基因組DNA中進行擴增,那時間延伸到10min也是可以的),變性時間通常也是30S足夠了,也可以根據(jù)擴增片段長度(是擴增片段長度而不是原始模板長度)和GC含量進行微調(diào)。 退火是為了讓引物與模板結(jié)合,一般來講30s足夠了,如果退火時間延長那么引物在酶的作用下就會進行擴增反應(yīng),因此在擴增比較短的片段時通常會把退火和延伸步驟合并(即所謂的兩步法擴增) |

銀蟲 (初入文壇)
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