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pangrui1985銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
并行版的SIESTA不能運行 已有1人參與
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編譯能通過，但運行老是報錯 mpirun noticed that process rank 34 with PID 24030 on node fn043 exited on signal 11 連tests里面的si64都報錯，所以我覺得不是簡單的內存問題。 下面是我的make文件，請高手指教一下出了什么問題？是ldau版的 .SUFFIXES: .SUFFIXES: .f .F .o .a .f90 .F90 SIESTA_ARCH=x86_64-unknown-linux-gnu--Intel FPP= FPP_OUTPUT= FC=/home-fn/compiler/mpi/openmpi-1.4.4-pgi/bin/mpif90 RANLIB=ranlib SYS=nag SP_KIND=4 DP_KIND=8 KINDS=$(SP_KIND) $(DP_KIND) FFLAGS=-g -assume byterecl -heap-arrays 64 FPPFLAGS= -DMPI -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT LDFLAGS= ARFLAGS_EXTRA= FCFLAGS_fixed_f= FCFLAGS_free_f90= FPPFLAGS_fixed_F= FPPFLAGS_free_F90= BLAS_LIBS=-L/home-fn/compiler/intel/mk/lib/intel64 -lmkl_scalapack_ilp64 -lmkl_cdft_core -lmkl_intel_ilp64 -l mkl_core -lmkl_sequential -lmkl_blacs_intelmpi_ilp64 -lpthread -lm LAPACK_LIBS=-L/home-fn/compiler/intel/mk/lib/intel64 -lmkl_scalapack_ilp64 -lmkl_cdft_core -lmkl_intel_ilp64 -lmkl_core -lmkl_sequential -lmkl_blacs_intelmpi_ilp64 -lpthread -lm BLACS_LIBS=-L/home-fn/compiler/intel/mkl/lib/intel64 -lmkl_blacs_intelmpi_ilp64 -lmkl_intel_ilp64 -lmkl_core -lmkl_sequential -lpthread -lm SCALAPACK_LIBS=-L/home-fn/compiler/intel/mkl/lib/intel64 -lmkl_scalapack_ilp64 -lmkl_intel_ilp64 -lmkl_core - lmkl_sequential -lpthread -lm COMP_LIBS=dc_lapack.a liblapack.a libblas.a NETCDF_LIBS= NETCDF_INTERFACE= LIBS=$(SCALAPACK_LIBS) $(BLACS_LIBS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(NETCDF_LIBS) #SIESTA needs an F90 interface to MPI #This will give you SIESTA's own implementation #If your compiler vendor offers an alternative, you may change #to it here. MPI_INTERFACE=libmpi_f90.a MPI_INCLUDE=/home-fn/compiler/mpi/openmpi-1.4.4-pgi/include DEFS_MPI = -DMPI #Dependency rules are created by autoconf according to whether #discrete preprocessing is necessary or not. .F.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_fixed_F) $< .F90.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_free_F90) $< .f.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_fixed_f) $< .f90.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_free_f90) $< |
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mywai520
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2樓2014-05-13 18:38:51
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