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高通量測序中PCR擴(kuò)增偏向性問題 已有1人參與
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誰能給一個好的詳細(xì)的說明 最好有相關(guān)文獻(xiàn) |
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 miRNA測序數(shù)據(jù)分析 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
大爺給跪了: 金幣+5, ★★★很有幫助 2014-05-18 15:05:22
myprayer: 金幣+1, 贈人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-05-18 17:19:38
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曾經(jīng)在測序公司工作過，現(xiàn)在不做測序很久了。無法給你相關(guān)文獻(xiàn)。說說我對這個問題的理解吧。 無論是一代測序還是二代測序，都是對一群DNA分子的測序，就是說要經(jīng)過PCR。據(jù)說三代測序可以實現(xiàn)單分子測序。 二代測序中，需要制備測序文庫，在文庫制備或者測序過程中就會出現(xiàn)提主所說的PCR偏向性問題了。在同一體系中，高GC、有二級結(jié)構(gòu)的片段顯然被擴(kuò)增的機(jī)會相對少。在測序結(jié)果中，某一片段的重復(fù)數(shù)，究竟是樣品本身真實情況還是由于PCR帶來的，就會出現(xiàn)偏差。從而對測序結(jié)果產(chǎn)生影響。 |
2樓2014-05-18 15:03:11
3樓2014-05-18 15:09:18
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