 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1661 | 回復(fù): 1 | |||
liumang12712銀蟲 (初入文壇)
|
[求助]
關(guān)于motif的問題
|
| 大家好，有誰能夠給我講講motif嗎？比如知道一個(gè)基因的蛋白序列，知道它是一個(gè)DNA binding蛋白，通過NCBI知道它有三段DNA binding位點(diǎn)，但是老板說讓我找到這個(gè)基因的motif，然后看在這個(gè)motif的上下游有哪些基因。怎么找這個(gè)motif啊，而且怎么找到這個(gè)motif上下游的基因呢？謝謝大家啦！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
考研調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
297求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
一志愿武漢理工，總分321，英一數(shù)二，求老師收留。
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
343求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
085601材料工程找調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
求調(diào)劑，一志愿 南京航空航天大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩，總分289分
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿南航 335分 | 0856 | GPA 4.07 | 有科研經(jīng)歷
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
340求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿北化求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 關(guān)于蛋白酶特異性斷裂氨基酸序列的問題
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 序列比對(duì)軟件的選擇和進(jìn)化樹制作
已經(jīng)有9人回復(fù)
- excel表中 輸入公式需用多層IF函數(shù)問題
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 求Motif detection的MEME軟件
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 求助文獻(xiàn)！關(guān)于基因與酶活性中心關(guān)系以及酶活性中心測(cè)定文獻(xiàn)
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 請(qǐng)教個(gè)問題，XRD衍射強(qiáng)度If和Iv分別是什么意思
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助】關(guān)于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合點(diǎn)的PWM
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】ISIF設(shè)置的問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助/交流】根據(jù)幾個(gè)測(cè)出的氨基酸序列如何進(jìn)行比對(duì)求motif
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 有關(guān)IFITA2011的計(jì)算機(jī)科學(xué)�？瘑栴}
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【分享】MEGA4的中文使用說明
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】自己寫的C語言，突然想看看C++是什么，求助一下。還有C語言和C++有什么區(qū)別啊
已經(jīng)有22人回復(fù)
- 【分享】蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)流程
已經(jīng)有32人回復(fù)
- 【求助/交流】關(guān)于微陣列實(shí)驗(yàn)
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 生物學(xué)軟件介紹及其下載地址【學(xué)生物的會(huì)很有用】
已經(jīng)有24人回復(fù)
- 與藥物設(shè)計(jì)有關(guān)的數(shù)據(jù)庫，不知對(duì)大家有用沒
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 生物信息學(xué)專題－生物版，醫(yī)學(xué)版和信息科學(xué)版共同創(chuàng)建
已經(jīng)有87人回復(fù)
biofandandan
金蟲 (正式寫手)
- 博學(xué)EPI: 2
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 1962.7
- 散金: 46
- 紅花: 5
- 沙發(fā): 1
- 帖子: 544
- 在線: 34.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 2120853
- 注冊(cè): 2012-11-12
- 性別: MM
- 專業(yè): 生物信息學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
|
motif在線查詢： http://motif.genome.jp/，這是網(wǎng)址，你試試 另外，PROSITE：http://cn.expasy.org/tools/scanprosite/ 是專門搜索蛋白質(zhì)Motif的數(shù)據(jù)庫，其中signature seqs是最重要的motif信息。 關(guān)于上下游基因的尋找，用基因組瀏覽器最方便了：http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway 最上面一排選擇好基因的信息 包括物種分類 物種名 基因組版本 位置 關(guān)鍵詞 （后兩個(gè)中隨便填一個(gè)就行了） 找到你想要的基因之后，在圖中你想要的基因的上點(diǎn)擊右鍵 選擇Get DNA for XXX(基因名) 之后會(huì)彈出一個(gè)窗口 在Sequence Retrieval Region Options下面就可以分別填寫你需要的上下游序列長度其他的選項(xiàng)可以先默認(rèn)（以后慢慢研究吧），點(diǎn)擊最下面Get DNA就搞定了 最后是以FASTA格式輸出的 右鍵另存為txt或者全選復(fù)制粘貼就行了 |
2樓2014-07-10 16:29:41
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 liumang12712 的主題更新
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 318一志愿吉林大學(xué)生物與醫(yī)藥 求調(diào)劑 +3 | 篤行致遠(yuǎn). 2026-03-28 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料學(xué)碩333求調(diào)劑 +11 | 北道巷 2026-03-24 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑求院校招收 +6 | 鶴鯨鴿 2026-03-28 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 291求調(diào)劑 +4 | Y-cap 2026-03-29 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | QiMing7 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料277求調(diào)劑 +7 | min3 2026-03-24 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 292求調(diào)劑 +14 | 鵝鵝鵝額額額額?/a> 2026-03-25 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 086502化學(xué)工程342求調(diào)劑 +6 | 阿姨復(fù)古不過 2026-03-27 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 085701環(huán)境工程求調(diào)劑 +9 | 多久上課 2026-03-27 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 312求調(diào)劑 +9 | 上岸吧ZJY 2026-03-22 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 292求調(diào)劑 +4 | 求求了收下我吧?/a> 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[碩博家園] 北京林業(yè)大學(xué)碩導(dǎo)招生廣告 +6 | kongweilin 2026-03-26 | 8/400 |
|
|
|
[考研]
 304材料求調(diào)劑
+4
|
鐘llll 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 325求調(diào)劑 +3 | Aoyijiang 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 271求調(diào)劑 +6 | 生如夏花… 2026-03-22 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 352求調(diào)劑 +4 | 大米飯！ 2026-03-22 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 309求調(diào)劑 +4 | gajsj 2026-03-25 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 290分調(diào)劑求助 +3 | 吉祥止止陳 2026-03-25 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 284求調(diào)劑 +15 | Zhao anqi 2026-03-22 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 318求調(diào)劑 +3 | plum李子 2026-03-23 | 3/150 |
|