 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 2294 | 回復(fù): 13 | ||
1334590579銅蟲 (初入文壇)
|
[求助]
使用mopac2012做完結(jié)構(gòu)優(yōu)化后如何從.out文件中得到結(jié)構(gòu)呢？ 已有4人參與
|
|
| 使用mopac2012做完結(jié)構(gòu)優(yōu)化后如何從.out文件中得到結(jié)構(gòu)呢？ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
求調(diào)劑，本科吉大，一志愿華工339
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
意大利博洛尼亞大學(xué)招聘研究助理2名（2D材料/鋰離子與鈉離子電池方向）
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有276人回復(fù)
-
關(guān)于碳量子點抗菌的研究
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
哈爾濱工業(yè)大學(xué)（深圳）綠色化學(xué)團隊招收2026年秋季入學(xué)博士生
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
南大化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
澳大利亞昆士蘭科技大學(xué)PhD博士獎學(xué)金
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
0703調(diào)劑
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
1
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
0703 調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 使用CASTEP進行結(jié)構(gòu)優(yōu)化的問題
已經(jīng)有25人回復(fù)
- 三種初始結(jié)構(gòu)得到三種不同的優(yōu)化結(jié)構(gòu)
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 石墨烯結(jié)構(gòu)優(yōu)化后的能量值是多少？
已經(jīng)有36人回復(fù)
- 請教用gaussian優(yōu)化構(gòu)型后得到的是log文件，如何把結(jié)構(gòu)導(dǎo)出？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- MOPAC結(jié)構(gòu)優(yōu)化如何得到分子結(jié)構(gòu)文件
已經(jīng)有5人回復(fù)
- MS建模時對模型結(jié)構(gòu)優(yōu)化的目的以及參數(shù)如何設(shè)置
已經(jīng)有5人回復(fù)
- vasp結(jié)構(gòu)優(yōu)化出現(xiàn)問題：算完一個離子步后就停止
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 結(jié)構(gòu)優(yōu)化和頻率分析時計算結(jié)果的頻率都是從7開始為什么不是從1開始，求高手解決，謝謝
已經(jīng)有3人回復(fù)
- vasp表面和吸附分子的結(jié)構(gòu)分別優(yōu)化后，如何將它們放到一起
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 如何讓高斯在優(yōu)化結(jié)構(gòu)時保持其中某個單鍵不變
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 優(yōu)化好的分子結(jié)構(gòu)，用gaussview打開后保存為高斯輸入文件，再用該文件做TD，對嗎
已經(jīng)有5人回復(fù)
- VASP結(jié)構(gòu)優(yōu)化后，最下面一層固定的原子也移動了，怎么回事？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 對irc得到的結(jié)構(gòu)是否可以（or 需要）作進一步結(jié)構(gòu)優(yōu)化？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- vasp結(jié)構(gòu)優(yōu)化中EDIFF以及KPOINTS設(shè)置，以及氫吸附結(jié)合能問題！
已經(jīng)有17人回復(fù)
- 結(jié)構(gòu)優(yōu)化的結(jié)果竟然重復(fù)不出來，每次優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)都不一樣，求高手解答……
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 怎樣在DMol3 結(jié)構(gòu)優(yōu)化中使構(gòu)型基本保持不變？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 結(jié)構(gòu)優(yōu)化中問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 關(guān)于結(jié)構(gòu)優(yōu)化中的對稱性問題
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】結(jié)構(gòu)優(yōu)化之后的靜態(tài)自洽計算
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【求助】結(jié)構(gòu)優(yōu)化中，如何選擇POTIM？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助】結(jié)構(gòu)優(yōu)化時如何將原子位置固定在原胞內(nèi)
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助成功】VASP中，如何固定磁矩做結(jié)構(gòu)優(yōu)化
已經(jīng)有14人回復(fù)
雪狼乖乖 
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 18 (小學(xué)生)
- 貴賓: 0.005
- 金幣: 2805.8
- 散金: 567
- 紅花: 34
- 帖子: 901
- 在線: 402.2小時
- 蟲號: 532524
- 注冊: 2008-03-25
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
|
很簡單，你找 ATOM CHEMICAL X Y Z NUMBER SYMBOL (ANGSTROMS) (ANGSTROMS) (ANGSTROMS) 1 C -1.09107905 * -1.57543613 * -0.30187106 * 2 C -0.28823482 * -1.22990859 * 0.78467546 * 3 C 0.31230698 * 0.03865173 * 0.78219605 * 把 1 C -1.09107905 * -1.57543613 * -0.30187106 * 2 C -0.28823482 * -1.22990859 * 0.78467546 * 3 C 0.31230698 * 0.03865173 * 0.78219605 * 這些復(fù)制到excel里，就是結(jié)構(gòu)，稍作處理就可以用了 |
6樓2014-07-12 17:02:14
chengjienjut
銅蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 1146.6
- 散金: 1
- 紅花: 1
- 帖子: 142
- 在線: 103小時
- 蟲號: 2015057
- 注冊: 2012-09-20
- 專業(yè): 有機化工
2樓2014-07-11 16:10:13
雪狼乖乖
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 18 (小學(xué)生)
- 貴賓: 0.005
- 金幣: 2805.8
- 散金: 567
- 紅花: 34
- 帖子: 901
- 在線: 402.2小時
- 蟲號: 532524
- 注冊: 2008-03-25
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
7樓2014-07-12 17:02:58
sobereva
至尊木蟲 (著名寫手)
本人已永久離開小木蟲
- QC強帖: 17
- 應(yīng)助: 226 (大學(xué)生)
- 貴賓: 5.4
- 金幣: 2180.5
- 紅花: 217
- 帖子: 1241
- 在線: 366.8小時
- 蟲號: 281271
- 注冊: 2006-09-23
- 專業(yè): 宇宙學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zhou2009: 金幣+3 2014-07-13 06:42:21
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zhou2009: 金幣+3 2014-07-13 06:42:21
|
可以參考此貼 將MOPAC2012的幾何優(yōu)化過程轉(zhuǎn)換為xyz軌跡文件的小工具 http://hi.baidu.com/sobereva/item/02416ec7f5676010505058e2 利用此工具和VMD程序，不僅可以觀看最后優(yōu)化的結(jié)構(gòu)，還可以看優(yōu)化過程，十分方便 |
9樓2014-07-12 22:59:51
1334590579
銅蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 146.5
- 帖子: 12
- 在線: 37小時
- 蟲號: 1445968
- 注冊: 2011-10-16
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
3樓2014-07-11 19:40:14
chengjienjut
銅蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 1146.6
- 散金: 1
- 紅花: 1
- 帖子: 142
- 在線: 103小時
- 蟲號: 2015057
- 注冊: 2012-09-20
- 專業(yè): 有機化工
4樓2014-07-11 21:13:05
crosschannel
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 12 (小學(xué)生)
- 金幣: 998.5
- 散金: 28
- 紅花: 13
- 帖子: 998
- 在線: 236.3小時
- 蟲號: 2615554
- 注冊: 2013-08-25
- 專業(yè): 質(zhì)譜分析
5樓2014-07-12 07:02:23
1334590579
銅蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 146.5
- 帖子: 12
- 在線: 37小時
- 蟲號: 1445968
- 注冊: 2011-10-16
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
8樓2014-07-12 22:12:02
雨泊
銅蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 355
- 散金: 60
- 帖子: 32
- 在線: 11.5小時
- 蟲號: 4046599
- 注冊: 2015-09-01
- 性別: GG
- 專業(yè): 物理學(xué)I
10樓2015-10-30 09:36:27
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 1334590579 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 277調(diào)劑 +5 | 自由煎餅果子 2026-03-16 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +5 | 上岸的小葡 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
[考研] 085601材料工程專碩求調(diào)劑 +4 | 慕寒mio 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 293求調(diào)劑 +6 | 世界首富 2026-03-11 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿天津大學(xué)化學(xué)工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑 +5 | yangfz 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[基金申請] 被我言中：新模板不強調(diào)格式了，假專家開始管格式了 +3 | beefly 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 東南大學(xué)364求調(diào)劑 +5 | JasonYuiui 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 文思客 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +3 | 劉夢微 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +3 | zjy101327 2026-03-11 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 336求調(diào)劑 +6 | Iuruoh 2026-03-11 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料工程調(diào)劑 +9 | 咪咪空空 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +7 | 7712b 2026-03-13 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +3 | miaodesi 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 26調(diào)劑/材料科學(xué)與工程/總分295/求收留 +9 | 2026調(diào)劑俠 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 277求調(diào)劑 +4 | anchor17 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +3 | 李政瑩 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0817化學(xué)工程與技術(shù)考研312分調(diào)劑 +3 | T123 tt 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 化工學(xué)碩306求調(diào)劑 +9 | 42838695 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +3 | 柯淮然 2026-03-10 | 8/400 |
|