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1334590579銅蟲 (初入文壇)
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使用mopac2012做完結(jié)構(gòu)優(yōu)化后如何從.out文件中得到結(jié)構(gòu)呢？ 已有4人參與
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| 使用mopac2012做完結(jié)構(gòu)優(yōu)化后如何從.out文件中得到結(jié)構(gòu)呢？ |
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雪狼乖乖 
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很簡單，你找 ATOM CHEMICAL X Y Z NUMBER SYMBOL (ANGSTROMS) (ANGSTROMS) (ANGSTROMS) 1 C -1.09107905 * -1.57543613 * -0.30187106 * 2 C -0.28823482 * -1.22990859 * 0.78467546 * 3 C 0.31230698 * 0.03865173 * 0.78219605 * 把 1 C -1.09107905 * -1.57543613 * -0.30187106 * 2 C -0.28823482 * -1.22990859 * 0.78467546 * 3 C 0.31230698 * 0.03865173 * 0.78219605 * 這些復(fù)制到excel里，就是結(jié)構(gòu)，稍作處理就可以用了 |
6樓2014-07-12 17:02:14
chengjienjut
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2樓2014-07-11 16:10:13
雪狼乖乖
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7樓2014-07-12 17:02:58
sobereva
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可以參考此貼 將MOPAC2012的幾何優(yōu)化過程轉(zhuǎn)換為xyz軌跡文件的小工具 http://hi.baidu.com/sobereva/item/02416ec7f5676010505058e2 利用此工具和VMD程序，不僅可以觀看最后優(yōu)化的結(jié)構(gòu)，還可以看優(yōu)化過程，十分方便 |
9樓2014-07-12 22:59:51
1334590579
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