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xueyiran2007銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
VMD顯示Lammps軌跡文件.lammpstrj
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利用VMD顯示lammps模擬水溶液的軌跡文件，存在如下問題，請各位大神幫忙： 1. 利用CPK顯示，由于周期性邊界，有些盒子邊界的H-O鍵，跨過整個盒子，請問如何去除這些鍵？ 2 水中H-H之間沒鍵，但VMD上H-H之間卻顯示成鍵，請問這個如何去除？ 3. H，O原子半徑大小顯示相同，實際上O的半徑要大，如何設定H,O的半徑？ 我試圖用VMD-graphics-representations-create rep-selected atoms來選擇H，O，但選擇不上，請問selected atoms選項如何輸入才能選擇上某個原子？我查看了下手冊，沒搞明白。 |
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mileyfan
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