 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 852 | 回復(fù): 3 | |||
[求助]
關(guān)于本地blast的問題 已有2人參與
|
|
求大神指導(dǎo)！我是用的單機版blast，輸出的txt文本只有1KB且沒有有用信息。不知道為什么會出現(xiàn)這樣的情況。 具體步驟如下： 我下載了blast-2.2.26-ia32-win32，下了nr數(shù)據(jù)庫，并把nr和我要測的序列復(fù)制到了bin文件夾中，把我要測序的序列命名為seqin，分別去掉了擴展名。 在cmd中，到了bin，進行fromatdb -i nr -p F，又輸入blastall -p blastn -i seqin.txt -d nr -e 0.0000000001 -o seqout.txt，可是最后輸出的txt都只有1KB，且沒有有用信息。 本人接觸blast沒幾天，上面的步驟都是我根據(jù)各種教材拼拼湊湊來的，我還屬于一竅不通狀態(tài)，不知道上面過程哪里出錯了，如果整體不對望給出詳細過程～～謝謝啦！ [ Last edited by numb123 on 2014-7-18 at 21:17 ] |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
不合理蛙科研實驗中的趣事：實驗器材的 “烏龍”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實驗中的趣事：和實驗材料的 “斗智斗勇”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
化學工程及工業(yè)化學論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有287人回復(fù)
-
蛋白質(zhì)檢測：精準分析，解鎖生物分子的密碼
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實驗之小鼠實驗：嚴謹設(shè)計，解析生命機制的重要載體
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實驗之重金屬檢測：精準篩查，守護健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實驗之“蛙測重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實驗之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標南京
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 請教，轉(zhuǎn)錄組測序與基因組測序結(jié)果分析
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 請教一個生物信息學BLAST問題。
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 如何批量blast？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 為什么測得的序列在NCBI里blast不出來？
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 關(guān)于Blast的用法
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 如何尋找目的基因
已經(jīng)有6人回復(fù)
- BLAST的使用方法
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 如何用Spass建立數(shù)據(jù)
已經(jīng)有4人回復(fù)
- NCBI blast 序列比對遇到的問題
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 批量Blast比對
已經(jīng)有7人回復(fù)
- NCBI在線blast的問題
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 為什么要用本地blast
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 如何使用blast建立本地數(shù)據(jù)庫（我下了很多fasta文件存放在一個文件夾里）
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 用一對引物blast多條序列
已經(jīng)有5人回復(fù)
- Blast哪里下載？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助/交流】請教blast結(jié)果的解讀
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【分享】蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測流程
已經(jīng)有32人回復(fù)
wizardfan
至尊木蟲 (著名寫手)
- MolEPI: 4
- 應(yīng)助: 599 (博士)
- 貴賓: 1.818
- 金幣: 24632.2
- 散金: 197
- 紅花: 48
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 2254
- 在線: 400.7小時
- 蟲號: 1879241
- 注冊: 2012-07-05
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物信息學
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
kx444555: 金幣+2, 鼓勵交流 2014-07-21 08:25:04
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
kx444555: 金幣+2, 鼓勵交流 2014-07-21 08:25:04
|
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK52637/ nr你是怎么下載的？有沒有用update_blastdb？用了的話，那nr就可以直接用，不用formatdb。 你還是仔細看看文檔再說 |
2樓2014-07-20 07:17:16
3樓2014-07-20 08:13:11
4樓2014-07-21 06:39:17
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 numb123 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 華東師范大學-071000生物學-293分-求調(diào)劑 +3 | 研究生何瑤明 2026-03-18 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學 ，070300化學學碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +3 | 晨昏線與星海 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
[考研] 317求調(diào)劑 +8 | 申子申申 2026-03-19 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 22408 344分 求調(diào)劑 一志愿 華電計算機技術(shù) +4 | solanXXX 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 南昌大學材料專碩311分求調(diào)劑 +5 | 77chaselx 2026-03-20 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿武漢理工材料工程專碩調(diào)劑 +9 | Doleres 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿蘇州大學材料求調(diào)劑，總分315（英一） +5 | sbdksD 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 316求調(diào)劑 +5 | 梁茜雯 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 261求B區(qū)調(diào)劑，科研經(jīng)歷豐富 +3 | 牛奶很忙 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考博] 招收博士1-2人 +3 | QGZDSYS 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 081700化工學碩調(diào)劑 +3 | 【1】 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿985，本科211，0817化學工程與技術(shù)319求調(diào)劑 +10 | Liwangman 2026-03-15 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 化學工程321分求調(diào)劑 +15 | 大米飯！ 2026-03-15 | 18/900 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +12 | 小熊joy 2026-03-14 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 303求調(diào)劑 +4 | 睿08 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 生物學071000 329分求調(diào)劑 +3 | 我愛生物生物愛?/a> 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 考研化學學碩調(diào)劑，一志愿985 +4 | 張vvvv 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +3 | mlpqaz03 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0856專碩279求調(diào)劑 +5 | 加油加油！? 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +4 | 這么名字咋樣 2026-03-14 | 6/300 |
|