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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » 其他 » PYMOL作圖問題
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lindashang銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
PYMOL作圖問題 已有1人參與
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大家好，請問四個問題 1，在選配體氫鍵連接殘基時，如何選擇不會出錯，有何竅門？ 2，殘疾label的字體、大小寫、內容、顏色怎么改呢？ 3、如何撤銷一個操作？ctrl+z？ 4、我把受體改為show surface，怎么配體和MgATP不顯示了，show sticks也不出 非常感謝大家的回答！！很著急，弄好久啦 |
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老曼7
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
lindashang(月只藍代發(fā)): 金幣+4, 感謝指導！ 2014-07-22 18:51:20
lindashang: 金幣+2, ★★★很有幫助 2014-08-12 19:03:30
lindashang(月只藍代發(fā)): 金幣+4, 感謝指導！ 2014-07-22 18:51:20
lindashang: 金幣+2, ★★★很有幫助 2014-08-12 19:03:30
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第一個問題不是很懂你是啥意思，配體和蛋白質之間要形成氫鍵得有一個距離和角度吧，你難道是在Editing的模式下手動挪動小分子？ 第二個問題，在pymol的命令行可以很好的解決，pymol有一系列的set命令，要更改label的這些屬性，你只需要在命令行里輸入：set label_xxx， xxx是相應屬性的英文。別告訴我說你不知道pymol的命令行在哪兒。另外給一個的小提示，pymol的命令行也是和linux一樣可以用Tab鍵補全命令的。像”set label_“，再按tab就可以看到能輸入什么了。 第三個問題，在3-button-viewing狀態(tài)下好像是沒有ctrl+z的操作的，回到原來的狀態(tài)就是進行一次相反的操作，如果show了stick，只要再hide掉就行了。而在editing模式下就能用ctrl+Z了。 第四個問題，角度和透明度問題，在seting菜單有transparency選項，把suface的透明度調為50就可以了。 |
2樓2014-07-21 19:00:40
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